156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3452 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3452  HNH endonuclease  100 
 
 		 341 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  77.75 
 
 		 472 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  36.56 
 
 		 458 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  34.26 
 
 		 441 aa  155  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  31.59 
 
 		 504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  29.39 
 
 		 434 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  29.39 
 
 		 430 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  29.45 
 
 		 426 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  29.77 
 
 		 430 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  40.98 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  31.01 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  44.12 
 
 		 485 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  29.43 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  48.94 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  29.43 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  48.94 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  29.49 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  46.59 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  45.74 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  45.74 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  28.77 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  46.81 
 
 		 438 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  46.81 
 
 		 438 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  41.51 
 
 		 469 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  47.87 
 
 		 437 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  46.81 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  45.1 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  28.3 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  47.73 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  44.68 
 
 		 466 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  44.68 
 
 		 480 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  44.68 
 
 		 489 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  44.68 
 
 		 481 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  46.81 
 
 		 256 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  28.57 
 
 		 561 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  29.29 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  43.82 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  34.68 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  38.61 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  28.92 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  28.16 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  34.95 
 
 		 620 aa  69.7  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  35.88 
 
 		 469 aa  69.3  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  35.96 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  36.72 
 
 		 627 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  52.11 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  32.82 
 
 		 432 aa  65.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  39.33 
 
 		 572 aa  65.9  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  33.33 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  42.71 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  35.19 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  39.58 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  38.61 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  38.78 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  41.11 
 
 		 540 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  30.12 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  28 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  39.78 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  41.89 
 
 		 532 aa  56.2  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  37.63 
 
 		 551 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  40.54 
 
 		 437 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.93 
 
 		 567 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  38.38 
 
 		 495 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  40.45 
 
 		 497 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  38.38 
 
 		 518 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  38.96 
 
 		 531 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  38.38 
 
 		 513 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 628 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  28.16 
 
 		 512 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  27.37 
 
 		 505 aa  53.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2722  HNH nuclease  33.64 
 
 		 571 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1075  hypothetical protein  35.35 
 
 		 558 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128214  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  24.62 
 
 		 620 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0743  hypothetical protein  35.35 
 
 		 553 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  33.67 
 
 		 507 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1011  hypothetical protein  40.68 
 
 		 564 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  32.5 
 
 		 580 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0795  hypothetical protein  34.34 
 
 		 552 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125968  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  38.83 
 
 		 443 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  42.25 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  42.25 
 
 		 492 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  34.4 
 
 		 499 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  31.58 
 
 		 585 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  37.86 
 
 		 443 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  42.25 
 
 		 446 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  30.84 
 
 		 418 aa  50.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0792  hypothetical protein  32.52 
 
 		 553 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  40.85 
 
 		 492 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  40.85 
 
 		 492 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  40.85 
 
 		 493 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  39.24 
 
 		 593 aa  49.3  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  38.68 
 
 		 516 aa  49.3  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  26.81 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0994  HNH nuclease  37.63 
 
 		 153 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.497036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  47.95 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  31.58 
 
 		 566 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  45.65 
 
 		 535 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  40.85 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  31.4 
 
 		 605 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>