More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3438 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  100 
 
 		 145 aa  293  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  92.74 
 
 		 188 aa  230  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4009  transposase, IS4  78 
 
 		 256 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  53.97 
 
 		 177 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4189  putative transposase  72.37 
 
 		 79 aa  120  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4225  putative transposase  72.37 
 
 		 79 aa  120  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3079  hypothetical protein  72.97 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  55.83 
 
 		 303 aa  117  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  55.83 
 
 		 303 aa  117  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  55.83 
 
 		 303 aa  117  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20960  putative Transposase, IS4 family  56.1 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  52.03 
 
 		 304 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01990  putative Transposase, IS4  47.93 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  55.93 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  52 
 
 		 184 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  52 
 
 		 184 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23120  putative Transposase, IS4 family  45.45 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14930  putative Transposase, IS4 family  45.45 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14820  putative Transposase, IS4 family  45.45 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0399604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06560  putative Transposase, IS4 family  45.45 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14750  putative Transposase, IS4 family  46.28 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.337332  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15000  putative Transposase, IS4 family  45.45 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.09593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21800  putative Transposase, IS4 family  46.28 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20472  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2685  transposase, IS4  49.15 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06540  putative Transposase IS4  45.45 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231609  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  57.14 
 
 		 287 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  55.32 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  48.31 
 
 		 294 aa  90.9  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13890  transposase family protein  54.46 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.417706  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  43.86 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  43.7 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  45.83 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  45.83 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  45.83 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5459  transposase IS4 family protein  39.81 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00365854  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0767  transposase IS4 family protein  41 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  37.72 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  41.84 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.03 
 
 		 281 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  37.72 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  41.84 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  41.84 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  41.84 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  41.84 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  41.84 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  41.84 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  41.84 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  41.84 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  41.84 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  41.84 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  41.84 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.03 
 
 		 281 aa  70.5  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  41.84 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  41.84 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  38.53 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  41.84 
 
 		 176 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  41.84 
 
 		 176 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  43.16 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  37.04 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  37.04 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  37.04 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  42.71 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  37.04 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  37.04 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.17 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  43.12 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  36.45 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  36.45 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  36.45 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  36.45 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  37.37 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  37.37 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  43.12 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  43.12 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  37 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  37 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.32 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  37 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1323  ISCc1, transposase OrfB  37.37 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  37 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  37 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  36.17 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  36.17 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  36.17 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  36.17 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  36.17 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  36.17 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  36.17 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  36.17 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  35.79 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  35.79 
 
 		 336 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  36.17 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  36.17 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  36.17 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  36.17 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  36 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  38.61 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  38.61 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  35.79 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  38.61 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>