157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3412 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 
353 aa  713    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  78.82 
 
 
509 aa  534  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4192  IS6 family transposase  90.91 
 
 
198 aa  341  9e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4193  transposase  84.8 
 
 
122 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.67 
 
 
546 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.67 
 
 
546 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.53 
 
 
511 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3980  putative transposase  98.8 
 
 
83 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  29.76 
 
 
539 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.04 
 
 
520 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.25 
 
 
518 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.13 
 
 
518 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.13 
 
 
518 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.24 
 
 
549 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.36 
 
 
378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6768  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.77 
 
 
501 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403374  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.15 
 
 
487 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.15 
 
 
487 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.15 
 
 
487 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.15 
 
 
545 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.15 
 
 
545 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.15 
 
 
545 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.71 
 
 
570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.47 
 
 
562 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5451  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.42 
 
 
536 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.268297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4090  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.56 
 
 
441 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7030  transposase  64.2 
 
 
153 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465964  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1079  ISL3 family transposase  27.65 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.464356 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5414  hypothetical protein  31.96 
 
 
225 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.678656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4643  hypothetical protein  35.87 
 
 
280 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4223  insertion element IS466S transposase  49.49 
 
 
103 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1852  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.59 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.516656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3383  transposase  26.64 
 
 
237 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  27.05 
 
 
476 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.905986  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  39.64 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3935  putative transposase  35.4 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3057  transposase  36.25 
 
 
89 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  34.62 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3934  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  31.16 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4809  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.4 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0631  transposase  31.09 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0849  transposase  31.09 
 
 
418 aa  60.5  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.414114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1162  transposase  31.09 
 
 
418 aa  60.5  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1556  transposase  31.09 
 
 
418 aa  60.5  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1692  transposase  31.09 
 
 
442 aa  60.5  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.67531  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3040  insertion element is466s transposase  32.04 
 
 
192 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6734  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.88 
 
 
344 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0015  transposase  27.05 
 
 
299 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0249  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.41 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0351  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.41 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.172822  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1023  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.41 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0717423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1186  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.41 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1348  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.41 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.41 
 
 
395 aa  57.4  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.395404  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1437  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.41 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.12833  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1562  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.41 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0664  ISChy4, transposase  35.35 
 
 
108 aa  57  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4192  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.86 
 
 
297 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3720  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.98 
 
 
186 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4212  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  58.97 
 
 
284 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1268  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.52 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3166  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.52 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2965  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.52 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1442  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.52 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3284  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.52 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  37.76 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4791  IstB ATP binding domain-containing protein  35.2 
 
 
284 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  28.16 
 
 
390 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  28.16 
 
 
390 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  28.16 
 
 
390 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  28.16 
 
 
390 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  32.79 
 
 
354 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  28.16 
 
 
390 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  28.16 
 
 
390 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  28.16 
 
 
390 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  28.16 
 
 
390 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  26.72 
 
 
390 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0290  integrase catalytic subunit  31.71 
 
 
495 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.196451  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0662  integrase catalytic subunit  31.71 
 
 
495 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102982  hitchhiker  0.000000317754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2239  integrase catalytic subunit  31.71 
 
 
495 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0237102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  32.46 
 
 
341 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  32.46 
 
 
341 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  32.46 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  31.91 
 
 
413 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0649  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3979  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.85 
 
 
65 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  32.46 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0019  ISPsy4, transposase  35.58 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0833  ISPsy4, transposase  35.58 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0865  ISPsy4, transposase  35.58 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1095  ISPsy4, transposase  35.58 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1659  ISPsy4, transposase  35.58 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2321  ISPsy4, transposase  35.58 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000712156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4013  ISPsy4, transposase  35.58 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4269  ISPsy4, transposase  35.58 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4625  ISPsy4, transposase  35.58 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4730  ISPsy4, transposase  35.58 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4769  ISPsy4, transposase  35.58 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5575  ISPsy4, transposase  35.58 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0040  ISPsy4, transposase  35.58 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.348986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>