73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3388 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  72.26 
 
 		 146 aa  207  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  71.01 
 
 		 137 aa  203  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  71.01 
 
 		 137 aa  203  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  73.72 
 
 		 146 aa  203  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  69.72 
 
 		 141 aa  196  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  58.39 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  48.76 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  37.9 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  38.52 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  37.9 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  36.8 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  36.8 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  36.8 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3587  hypothetical protein  40.38 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  33.09 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  31.97 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  29.29 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  32.64 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  31.15 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  34.04 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  32.65 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  28.21 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  30.33 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  29.73 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  27.82 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  31.13 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  32.8 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  26.92 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  27.74 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  30.58 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  28.93 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  35.58 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  26.32 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  31.37 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  26 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  29.7 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  37.33 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  32.32 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  26.45 
 
 		 576 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  36.36 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  27.12 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  24.8 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  23.01 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  28.68 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  31.09 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  24.77 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  26.8 
 
 		 315 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  29.2 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  31.07 
 
 		 413 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  27.59 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  23.08 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  22.55 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  29.59 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  24.04 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  23.53 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  29 
 
 		 550 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  29 
 
 		 550 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  29 
 
 		 550 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  25.98 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  25.49 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  29.03 
 
 		 129 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  28.16 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  19.61 
 
 		 178 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  26.9 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  32.26 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  25 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  22.86 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  23.33 
 
 		 319 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  27.55 
 
 		 548 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>