More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3357 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3357  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0520  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  56.77 
 
 		 272 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4415  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  57.26 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  56.83 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  47.41 
 
 		 236 aa  205  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  52 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  52.23 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4178  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  48.7 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4244  Fis family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0391426  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4400  Fis family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3597  response regulator receiver and unknown domain protein  47.62 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1528  response regulator receiver and unknown domain protein  45.3 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1769  response regulator receiver and unknown domain-containing protein  51.79 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.870814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2259  response regulator receiver and unknown domain protein  50.67 
 
 		 223 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00555688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  44.89 
 
 		 231 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  46.75 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2968  response regulator receiver and unknown domain protein  43.81 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33413  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4698  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  46.78 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.423451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  38.43 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  45.98 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0517  two component transcriptional regulator, Fis family  46.52 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.169907  normal  0.0442424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  42.17 
 
 		 243 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  39.29 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  37.44 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  41.26 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0508  response regulator receiver and unknown domain protein  43.36 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.957096  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  43.11 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.53 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5078  response regulator receiver and unknown domain protein  45.83 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.763511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  39.91 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  35.4 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2037  response regulator receiver  41.63 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  32.43 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  32.43 
 
 		 222 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3706  response regulator receiver and unknown domain protein  43.91 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.89 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14110  response regulator of citrate/malate metabolism  41.63 
 
 		 238 aa  136  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0325971  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.05 
 
 		 220 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.05 
 
 		 220 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  43.61 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.27 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.32 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  40.81 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  33.48 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  36.49 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  31.36 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  33.48 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  33.03 
 
 		 235 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  33.03 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  33.03 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  33.03 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  31.22 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  31.22 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  36.49 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.87 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.96 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  35.84 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  36.77 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  32.58 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  33.92 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1351  response regulator receiver and unknown domain protein  37.39 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.21 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1346  response regulator receiver and unknown domain protein  36.77 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000367941 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  33.92 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.16 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1303  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.87 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4785  response regulator receiver  36.64 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.286234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0577  response regulator  31.75 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  34.65 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  33.92 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  33.33 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  34.98 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2791  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.14 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00727267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.11 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  34.98 
 
 		 230 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  33.63 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  33.63 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  33.63 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  34.08 
 
 		 224 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 230 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  34.51 
 
 		 227 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.61 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0349  response regulator receiver  33.48 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2305  response regulator receiver and unknown domain protein  36.44 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0699  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.91 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0196  response regulator receiver and unknown domain protein  32.89 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.33 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.33 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.33 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.33 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.78 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1922  response regulator  28.32 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2225  response regulator receiver and unknown domain protein  31.86 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2326  response regulator receiver and unknown domain protein  32.44 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  29.65 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  29.65 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.65 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  29.65 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.65 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.65 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>