112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3356 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  100 
 
 		 544 aa  1087    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  76.29 
 
 		 541 aa  823    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  46.27 
 
 		 530 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  33.93 
 
 		 502 aa  277  3e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  37.2 
 
 		 513 aa  274  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  37.53 
 
 		 538 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  36.65 
 
 		 547 aa  256  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  36.2 
 
 		 546 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  34.55 
 
 		 543 aa  253  8.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  37.04 
 
 		 534 aa  247  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  29.53 
 
 		 534 aa  243  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  35.42 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  34.55 
 
 		 543 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  36.13 
 
 		 543 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  28.01 
 
 		 533 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  27.5 
 
 		 554 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.03 
 
 		 623 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  25.99 
 
 		 653 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  25.99 
 
 		 632 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  25.99 
 
 		 632 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  25.99 
 
 		 632 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  25.99 
 
 		 632 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  26.4 
 
 		 552 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  26.4 
 
 		 632 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.04 
 
 		 543 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  25.63 
 
 		 696 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 578 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 578 aa  97.1  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 540 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 591 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 591 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 591 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.64 
 
 		 572 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.49 
 
 		 557 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.65 
 
 		 1150 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1150 aa  87  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.15 
 
 		 786 aa  87  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 889 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  30.58 
 
 		 578 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.3 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 587 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.46 
 
 		 1132 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  29.2 
 
 		 569 aa  80.1  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.09 
 
 		 535 aa  73.9  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 547 aa  73.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.28 
 
 		 583 aa  73.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.92 
 
 		 543 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.05 
 
 		 567 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3364  hypothetical protein  23.3 
 
 		 738 aa  68.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451115  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.71 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1152 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.07 
 
 		 593 aa  64.7  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  27.88 
 
 		 622 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  25.56 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  25.23 
 
 		 551 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  30.23 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.53 
 
 		 582 aa  60.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.48 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.02 
 
 		 1152 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.58 
 
 		 552 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.22 
 
 		 550 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.07 
 
 		 561 aa  54.3  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.47 
 
 		 560 aa  53.9  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07121  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  22.16 
 
 		 547 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.569172  normal  0.139328 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.9 
 
 		 561 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.16 
 
 		 527 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.47 
 
 		 511 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  23.55 
 
 		 489 aa  52.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.31 
 
 		 546 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.88 
 
 		 562 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  22.32 
 
 		 521 aa  52  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.45 
 
 		 573 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 567 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  23.67 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.94 
 
 		 494 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.6 
 
 		 570 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.99 
 
 		 563 aa  51.2  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.44 
 
 		 563 aa  51.2  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.36 
 
 		 570 aa  50.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  26.02 
 
 		 1146 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 581 aa  50.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0088  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  23.49 
 
 		 547 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.22 
 
 		 567 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.12 
 
 		 570 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.39 
 
 		 579 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  24.84 
 
 		 528 aa  48.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.82 
 
 		 556 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4949  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.2 
 
 		 574 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.37 
 
 		 565 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  22.29 
 
 		 561 aa  47.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1814  oxidoreductase  26.5 
 
 		 547 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.315902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.34 
 
 		 559 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.85 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.14 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.23 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>