More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3310 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  92.6 
 
 		 453 aa  729    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  790    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  50.13 
 
 		 396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  46.79 
 
 		 397 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  49.74 
 
 		 550 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  49.48 
 
 		 550 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  49.48 
 
 		 550 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  44.78 
 
 		 396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  49.33 
 
 		 548 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  49.48 
 
 		 548 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  46.4 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  44.59 
 
 		 541 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  43 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  42.49 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.58 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  36.81 
 
 		 385 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  37.44 
 
 		 390 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  38.93 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.37 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  38.24 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  36.48 
 
 		 385 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  35.91 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  37.63 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  35.98 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  34.85 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.1 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  34.9 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  37.43 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  33.58 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.71 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  39.6 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  35.68 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  36.59 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  35.32 
 
 		 391 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  35.09 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  36.18 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.83 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  34.62 
 
 		 386 aa  177  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  35.66 
 
 		 383 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  32.27 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  42.64 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  33.67 
 
 		 385 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  36.63 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  34.11 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  38.27 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  37.88 
 
 		 402 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  33.85 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.98 
 
 		 389 aa  170  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  37.6 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  34.02 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  33.07 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.82 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  39.8 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  35.54 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  32.65 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  34.04 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  33.07 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  33.07 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  35.84 
 
 		 381 aa  162  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  37.36 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.88 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  34.75 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  33.17 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  35.41 
 
 		 389 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  32.38 
 
 		 388 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  34.09 
 
 		 389 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  33.85 
 
 		 389 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  31.87 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  31.23 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  33.42 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  30.91 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  33.86 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  32.06 
 
 		 380 aa  149  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  30.81 
 
 		 389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.32 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  31.15 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.79 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.79 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  32.73 
 
 		 388 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  32.49 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  31.65 
 
 		 378 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  36.91 
 
 		 381 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  34.55 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  31.03 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  33.24 
 
 		 385 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 		 388 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 		 388 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  34.44 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  29.95 
 
 		 388 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  31.9 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  30.47 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  30.99 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  31.03 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.59 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.09 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  34.51 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  35.34 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>