More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3309 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  100 
 
 		 318 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  66.35 
 
 		 318 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  63.69 
 
 		 317 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  64.44 
 
 		 318 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  64.44 
 
 		 318 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  63.17 
 
 		 317 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  64.44 
 
 		 318 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  57.78 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  56.05 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  56.05 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  56.05 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  55.1 
 
 		 318 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  54.78 
 
 		 318 aa  364  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  41.4 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  40.69 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.93 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  40 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  40 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  38.99 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  36.31 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  38.87 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  40.51 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  37.78 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  36.99 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  38.26 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  37.74 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  39.04 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  36.69 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  36.79 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  39.59 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  33.1 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  31.82 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 329 aa  108  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0705  hypothetical protein  46.85 
 
 		 143 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  27.59 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  29.67 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  29.85 
 
 		 359 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  28.97 
 
 		 341 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.4 
 
 		 336 aa  86.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  27.38 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  29.75 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.31 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  32.61 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.71 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  35.19 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.65 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.88 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  28.86 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0203  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  30.49 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  32.69 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  28.12 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  26.12 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  26.12 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  26.12 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  27.68 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.38 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.6 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.36 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  28.35 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.04 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  27.16 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  23.25 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.56 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  25.1 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  27.8 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  28.79 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  26.2 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  29.12 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  25.27 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  23.65 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  24.7 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.14 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  25.83 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.74 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  25.39 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  25.39 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.53 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  28.26 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  24.07 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  27.14 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  29.34 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  34.92 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.03 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  29.73 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  22.19 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  31.98 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  29.21 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.29 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  27.56 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.69 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  29.05 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  25.71 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  29.05 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  27.23 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  26.24 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  29.05 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>