45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3299 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  85.95 
 
 		 185 aa  348  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  71.89 
 
 		 185 aa  291  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  71.89 
 
 		 185 aa  291  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  71.89 
 
 		 185 aa  291  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  68.65 
 
 		 184 aa  276  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  63.78 
 
 		 185 aa  260  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  40.24 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  38.51 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  39.39 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  36.93 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  30.68 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  34.85 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  35.15 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  38.46 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  34.51 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  34.19 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  35.43 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  31.1 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  32.59 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  31.25 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  25.73 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  31.11 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  30.57 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  29.05 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  27.97 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  34.68 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  31.75 
 
 		 135 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  26.01 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  30.95 
 
 		 135 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  30.95 
 
 		 135 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  29.03 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  25.13 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  33.56 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  29.79 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  37.5 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  32.58 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  30.07 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  31.19 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  26.86 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  28.28 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  29.71 
 
 		 450 aa  41.6  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  25.77 
 
 		 221 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  27.78 
 
 		 172 aa  41.2  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>