More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3146 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3146  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 533 aa  1086    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.683024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  47.2 
 
 		 545 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4137  AMP-dependent synthetase and ligase  44.12 
 
 		 554 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  41.02 
 
 		 550 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  40.27 
 
 		 544 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  41.3 
 
 		 540 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  41.3 
 
 		 540 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  41.29 
 
 		 541 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  41.3 
 
 		 540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 		 566 aa  355  1e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  42.05 
 
 		 530 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 566 aa  353  4e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  40.43 
 
 		 544 aa  352  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  39.39 
 
 		 557 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 		 1043 aa  351  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  39.56 
 
 		 552 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  39.58 
 
 		 558 aa  347  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  39.01 
 
 		 557 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  39.2 
 
 		 562 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  39.96 
 
 		 538 aa  344  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  38.62 
 
 		 557 aa  343  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 		 539 aa  342  9e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  39.09 
 
 		 546 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  37.48 
 
 		 560 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 		 551 aa  340  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  38.7 
 
 		 539 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  38.89 
 
 		 546 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  38.51 
 
 		 546 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  37.91 
 
 		 560 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  38.05 
 
 		 565 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  39.37 
 
 		 538 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  36.71 
 
 		 560 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  40.62 
 
 		 549 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  36.9 
 
 		 560 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  37.67 
 
 		 558 aa  333  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 		 562 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  36.28 
 
 		 549 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  37.86 
 
 		 543 aa  330  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  36.6 
 
 		 552 aa  329  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  36.23 
 
 		 550 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  35.89 
 
 		 549 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.13 
 
 		 579 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  35.04 
 
 		 574 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  36.09 
 
 		 596 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  37.28 
 
 		 564 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  37.4 
 
 		 550 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  35.94 
 
 		 570 aa  326  6e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  35.94 
 
 		 570 aa  326  6e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  35.94 
 
 		 570 aa  326  6e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  38.62 
 
 		 561 aa  326  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17630  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.76 
 
 		 592 aa  326  8.000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100128  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 571 aa  326  8.000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  36.31 
 
 		 605 aa  326  8.000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  37.09 
 
 		 560 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  38.09 
 
 		 547 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  36.38 
 
 		 576 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  35.67 
 
 		 570 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  36.89 
 
 		 560 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  37.74 
 
 		 549 aa  325  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  36.5 
 
 		 574 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  36.67 
 
 		 601 aa  323  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  35.2 
 
 		 570 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 566 aa  323  6e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  35.38 
 
 		 570 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  38.07 
 
 		 546 aa  323  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  36.85 
 
 		 576 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  35.29 
 
 		 578 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  35.38 
 
 		 573 aa  320  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  36.61 
 
 		 549 aa  319  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  39.18 
 
 		 542 aa  319  7e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  35.83 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  35.05 
 
 		 587 aa  318  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  35.24 
 
 		 584 aa  318  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  36.9 
 
 		 518 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  35.76 
 
 		 579 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  36.4 
 
 		 548 aa  317  5e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  38.83 
 
 		 572 aa  316  7e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 550 aa  316  7e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  35.25 
 
 		 570 aa  316  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  34.67 
 
 		 579 aa  315  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  35.14 
 
 		 578 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  34.14 
 
 		 602 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  35.14 
 
 		 578 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  37.69 
 
 		 548 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  35.56 
 
 		 552 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  35.89 
 
 		 547 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  36.19 
 
 		 576 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  36.23 
 
 		 572 aa  312  7.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  36.52 
 
 		 576 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 		 563 aa  311  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  34.26 
 
 		 568 aa  309  9e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 		 542 aa  308  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  36.64 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  36.36 
 
 		 578 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  36.38 
 
 		 564 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  36.12 
 
 		 565 aa  307  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  36.86 
 
 		 577 aa  307  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  36.45 
 
 		 549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 		 596 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0241  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 		 545 aa  306  8.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276778  normal  0.182333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>