13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3030 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3030  hypothetical protein  100 
 
 
500 aa  998    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2196  hypothetical protein  66.41 
 
 
381 aa  480  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.455714  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2978  hypothetical protein  43.56 
 
 
514 aa  365  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  hitchhiker  0.00212324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1074  hypothetical protein  43.35 
 
 
514 aa  362  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4374  hypothetical protein  42.94 
 
 
514 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.200864  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2821  hypothetical protein  43.72 
 
 
398 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2195  hypothetical protein  51.96 
 
 
124 aa  90.1  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272656  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4073  hypothetical protein  78 
 
 
190 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2521  hypothetical protein  27.33 
 
 
371 aa  54.3  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0954  hypothetical protein  27.33 
 
 
466 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  hitchhiker  0.0000000572086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0372  hypothetical protein  27.33 
 
 
466 aa  53.9  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000191651  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0398  hypothetical protein  27.33 
 
 
466 aa  53.9  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000077648  normal  0.524896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0371  hypothetical protein  26.67 
 
 
172 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232238  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>