More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2913 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  100 
 
 
396 aa  811    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  76.57 
 
 
398 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  69.9 
 
 
408 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  69.92 
 
 
398 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  64.82 
 
 
399 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  62.5 
 
 
404 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  62.5 
 
 
404 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  62.5 
 
 
404 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  58.31 
 
 
413 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  60.81 
 
 
398 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  61.73 
 
 
401 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  61.73 
 
 
401 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  61.73 
 
 
401 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  57.22 
 
 
396 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  58.06 
 
 
403 aa  474  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  60.41 
 
 
397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  60.41 
 
 
397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  54.41 
 
 
400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  60.41 
 
 
397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  54.41 
 
 
400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  57 
 
 
395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  54.16 
 
 
400 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  55.08 
 
 
396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  55.24 
 
 
394 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  53.03 
 
 
406 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  54.41 
 
 
411 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  53.03 
 
 
418 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  55.24 
 
 
394 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  53.03 
 
 
406 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  54.1 
 
 
393 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  48.74 
 
 
427 aa  388  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  48.98 
 
 
395 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  47.73 
 
 
395 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  46.19 
 
 
395 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  47.73 
 
 
395 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4786  cytochrome P450 monooxygenase  43.15 
 
 
335 aa  316  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  40.92 
 
 
395 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  40.91 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  39.4 
 
 
401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  38.81 
 
 
405 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  38.81 
 
 
405 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  38.81 
 
 
405 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  38.65 
 
 
392 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  40.4 
 
 
398 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  38.08 
 
 
405 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  38.08 
 
 
405 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  38.08 
 
 
405 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  38.85 
 
 
412 aa  272  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  37.91 
 
 
405 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  35.95 
 
 
400 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  35.19 
 
 
400 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  34.94 
 
 
400 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  34.94 
 
 
400 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  36.3 
 
 
402 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  36.3 
 
 
402 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  36.3 
 
 
402 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  34.25 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  37.88 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  36.13 
 
 
387 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  34.8 
 
 
414 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  34.49 
 
 
412 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  33.91 
 
 
402 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3437  cytochrome P450  36.46 
 
 
418 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  33.66 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  36.39 
 
 
774 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.99 
 
 
380 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  36.6 
 
 
390 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  33.24 
 
 
395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  32.93 
 
 
413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.83 
 
 
388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  33.66 
 
 
408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  35.25 
 
 
403 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  33.51 
 
 
396 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  33.42 
 
 
411 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  37.34 
 
 
409 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  34.34 
 
 
405 aa  209  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  37.86 
 
 
404 aa  209  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  32.16 
 
 
411 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  32.43 
 
 
411 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  34.15 
 
 
398 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  34 
 
 
410 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  33.41 
 
 
398 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  33.41 
 
 
398 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  32.27 
 
 
411 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2708  putative cytochrome P450  32.47 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.42 
 
 
420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  32.59 
 
 
407 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  33.59 
 
 
399 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  33.93 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  33.73 
 
 
404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  32.49 
 
 
408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.51 
 
 
426 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  40.78 
 
 
1046 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  32.56 
 
 
406 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  31.88 
 
 
411 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  32.14 
 
 
414 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  33.68 
 
 
401 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0298  cytochrome P450  29.65 
 
 
392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  33.25 
 
 
409 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  34.48 
 
 
406 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>