92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2839 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2839  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1826  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  87.5 
 
 		 104 aa  187  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1815  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  82.52 
 
 		 104 aa  169  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  57 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9123  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  50.51 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0192  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  49.44 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109054  decreased coverage  0.00158686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4347  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  48.31 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.821265  normal  0.581747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4089  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.26 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3381  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.2 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0604341  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0395  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.11 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.194663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7703  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.36 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2625  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.48 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1250  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.26 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391093  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1828  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.89 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.896202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1862  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.84 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.731074  normal  0.634573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1071  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  39.8 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0179727  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1547  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.9 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2038  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.44 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2208  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  39.18 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0290031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2511  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.46 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000204873  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0741  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.83 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4044  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.96 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0745  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.48 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4119  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.96 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.619086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11184  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.71 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000707636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4273  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.96 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0680  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.67 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2684  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.9 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.819966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0707  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.67 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.289633 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1535  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.63 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000224149  normal  0.214474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4549  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.71 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.164761  normal  0.300182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3348  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.56 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.107615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31220  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.83 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12116  normal  0.529511 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0712  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.7 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.85 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1636  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.71 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.113224  normal  0.269211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2696  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.48 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2331  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.34 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2248  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.18 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00853902  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19130  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  34.04 
 
 		 238 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0088577  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5338  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.58 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1724  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.58 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0194781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.57 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1418  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.23 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2524  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.04 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3244  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.95 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1768  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.26 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1218  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.23 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  41.27 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1410  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.33 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4055  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.64 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.579809  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1942  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2199  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.57 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0131  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  27.47 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13127  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase moaB1  33.33 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.119308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0140  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.17 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1891  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.25 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0206929  normal  0.972327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3550  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.59 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3356  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.63 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0631  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.23 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00151713  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1536  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.71 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5000  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.17 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000718198  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3226  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.26 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0322  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.31 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1245  4A-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  29.23 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.361508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2244  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  27.47 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2674  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.35 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4051  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.03 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1232  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.75 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2809  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.26 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.891802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3734  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  21.74 
 
 		 97 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351271  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1611  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.96 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.871945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3519  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.28 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.777034 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05481  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (PCD)  23.91 
 
 		 101 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.713347  normal  0.538116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1481  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.91 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2387  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  34.25 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2161  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.94 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05181  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  27.17 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00643072  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05471  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  27.17 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.375908  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1646  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.33 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0328743 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29375  predicted protein  38.78 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.744138  normal  0.395144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.06 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1861  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.11 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100036  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0492  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  26.09 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.032217  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1537  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.11 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0264326 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1356  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.79 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.119123  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1985  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.63 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.253254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1468  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  27.78 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13356  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase moaB3  32.22 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.26741e-21  normal  0.214412 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.09 
 
 		 219 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0874  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.31 
 
 		 124 aa  40  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000104315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>