64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2802 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  100 
 
 		 537 aa  1079    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  40.19 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  38.81 
 
 		 484 aa  296  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  40.23 
 
 		 519 aa  263  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  37.94 
 
 		 519 aa  260  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  35.92 
 
 		 514 aa  227  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  67.74 
 
 		 346 aa  213  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  62.65 
 
 		 535 aa  206  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  32.84 
 
 		 526 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  67.57 
 
 		 527 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  66.1 
 
 		 255 aa  163  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  64.12 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  58.21 
 
 		 181 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  57.46 
 
 		 175 aa  143  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  31.31 
 
 		 503 aa  140  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  65.29 
 
 		 565 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0917  hypothetical protein  34.96 
 
 		 342 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  75.31 
 
 		 148 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  29.57 
 
 		 473 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  29.47 
 
 		 434 aa  98.2  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  29.18 
 
 		 418 aa  97.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  26.58 
 
 		 554 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  28.86 
 
 		 503 aa  93.6  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  29.24 
 
 		 478 aa  88.2  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  33.93 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  26.27 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.95 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  28 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  24.27 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  27.93 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  41.07 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  26.37 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.622079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  26.09 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  36.45 
 
 		 181 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  27.62 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  26.12 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  27.69 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  28.48 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  29.63 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  30.25 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  26.41 
 
 		 477 aa  57  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  23 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  27.8 
 
 		 413 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  23.89 
 
 		 401 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  25.23 
 
 		 414 aa  51.2  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 488 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  24.81 
 
 		 579 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  27.22 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  32.99 
 
 		 505 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1526 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  26.34 
 
 		 411 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  25.41 
 
 		 405 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  22.88 
 
 		 429 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  27.49 
 
 		 469 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  25.94 
 
 		 369 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  28.48 
 
 		 403 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 507 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  25.11 
 
 		 510 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01940  hypothetical protein  26.84 
 
 		 360 aa  44.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.705916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  26.85 
 
 		 388 aa  43.9  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.98 
 
 		 444 aa  43.5  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>