More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2726 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2726  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
404 aa  805  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3929  acetyl-CoA acetyltransferase  79.6 
 
 
403 aa  626  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.041846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1976  acetyl-CoA acetyltransferase  68.41 
 
 
405 aa  577  1e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  67 
 
 
405 aa  561  1e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1805  acetyl-CoA acetyltransferase  66.42 
 
 
404 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1758  acetyl-CoA acetyltransferase  66.42 
 
 
404 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  65.92 
 
 
404 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126801  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3827  acetyl-CoA acetyltransferase  68.49 
 
 
403 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1860  acetyl-CoA acetyltransferase  65.42 
 
 
402 aa  522  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00028581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1802  acetyl-CoA acetyltransferase  64.32 
 
 
407 aa  515  1e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7151  acetyl-CoA acetyltransferase  64.76 
 
 
405 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1524  acetyl-CoA acetyltransferase  61.67 
 
 
407 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1347  acetyl-CoA acetyltransferase  61.06 
 
 
403 aa  454  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.901733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4166  acetyl-CoA acetyltransferase  59.55 
 
 
407 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  54.93 
 
 
402 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.771451  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0124  acetyl-CoA acetyltransferase  54.43 
 
 
402 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0192  acetyl-CoA acetyltransferase  54.43 
 
 
402 aa  417  1e-115  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6898  acetyl-CoA acetyltransferase  54.84 
 
 
398 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7332  acetyl-CoA acetyltransferase  54.7 
 
 
401 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213335  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2896  acetyl-CoA acetyltransferase  54.07 
 
 
404 aa  396  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1222  acetyl-CoA acetyltransferase  52.48 
 
 
404 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0492457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  45.95 
 
 
393 aa  340  3e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  47.15 
 
 
394 aa  340  3e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  46.34 
 
 
394 aa  340  3e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  46.9 
 
 
394 aa  337  2e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  46.65 
 
 
394 aa  335  6e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  46.9 
 
 
394 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  45.25 
 
 
392 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  46.65 
 
 
394 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  46.4 
 
 
394 aa  329  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  326  4e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  45.16 
 
 
394 aa  325  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  46.65 
 
 
394 aa  326  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  45.41 
 
 
427 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  45.41 
 
 
427 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  45.41 
 
 
394 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  45.41 
 
 
394 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  45.41 
 
 
394 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  45.41 
 
 
427 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  44 
 
 
391 aa  323  4e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  45.16 
 
 
394 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3041  acetyl-CoA acetyltransferase  43.89 
 
 
392 aa  321  1e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
401 aa  319  4e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  44.03 
 
 
390 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  44.79 
 
 
403 aa  319  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  43.14 
 
 
391 aa  318  8e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
391 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
391 aa  316  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  41.42 
 
 
391 aa  316  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  44.17 
 
 
393 aa  316  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  1.97316e-05 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
391 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  44.55 
 
 
392 aa  315  8e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
391 aa  315  9e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
391 aa  315  9e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
391 aa  315  9e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
391 aa  315  9e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
391 aa  315  9e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  43.36 
 
 
394 aa  315  1e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  45.87 
 
 
402 aa  315  1e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  43.36 
 
 
394 aa  315  1e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  41.9 
 
 
391 aa  313  2e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  43.75 
 
 
394 aa  313  2e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
394 aa  313  3e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  43.5 
 
 
391 aa  313  3e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  44.7 
 
 
394 aa  313  4e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  43.47 
 
 
398 aa  313  4e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  43.5 
 
 
394 aa  313  5e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0641  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  45.64 
 
 
390 aa  312  7e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  42.79 
 
 
396 aa  312  8e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02110  hypothetical protein  44.55 
 
 
394 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  44.55 
 
 
394 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.39386  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  42.79 
 
 
392 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02151  acetyl-CoA acetyltransferase  44.55 
 
 
394 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  42.61 
 
 
394 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2365  acetyl-CoA acetyltransferase  44.55 
 
 
394 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  43.72 
 
 
392 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1426  acetyl-CoA acetyltransferase  44.55 
 
 
394 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000528422 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  42.54 
 
 
392 aa  310  3e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  44.96 
 
 
399 aa  310  3e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2373  acetyl-CoA acetyltransferase  44.55 
 
 
394 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2498  acetyl-CoA acetyltransferase  44.64 
 
 
389 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  46.17 
 
 
396 aa  309  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.42 
 
 
396 aa  309  6e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  42.61 
 
 
400 aa  309  6e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  43.39 
 
 
392 aa  308  8e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  45.16 
 
 
395 aa  307  2e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  45.54 
 
 
394 aa  306  4e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 
398 aa  306  5e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2213  acetyl-CoA acetyltransferase  43.98 
 
 
392 aa  306  5e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.56776e-06  normal  0.0132753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.09 
 
 
398 aa  306  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  42.39 
 
 
393 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  42.71 
 
 
394 aa  305  8e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  45.48 
 
 
402 aa  305  9e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  41.85 
 
 
398 aa  304  1e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  45.27 
 
 
393 aa  305  1e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  43.84 
 
 
394 aa  305  1e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3117  acetyl-CoA acetyltransferase  42.46 
 
 
393 aa  305  1e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  44.31 
 
 
397 aa  305  1e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  42.46 
 
 
392 aa  304  2e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  44.31 
 
 
409 aa  304  2e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>