More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2724 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 249 aa  484  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  53.33 
 
 		 254 aa  221  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  50.4 
 
 		 247 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  50.4 
 
 		 247 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  50.4 
 
 		 247 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.78 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  49.21 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  49.4 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.31 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.65 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  49.02 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  52.07 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  49.4 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  48.03 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.16 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  48.61 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.95 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  48.03 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.22 
 
 		 261 aa  197  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.66 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  45.88 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  48.98 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 		 267 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.97 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.26 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.24 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  46.43 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.22 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 264 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  46.06 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  42.06 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.02 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 		 259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  44 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  40.93 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  40.54 
 
 		 261 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 		 257 aa  168  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  40.54 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  40.54 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  40.54 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.32 
 
 		 261 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 263 aa  166  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.7 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  41.02 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.68 
 
 		 265 aa  165  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.24 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.88 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  42.53 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  38.91 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 		 797 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  39.77 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  43.19 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  39.77 
 
 		 297 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  39.77 
 
 		 297 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  39.77 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  41.31 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  39.77 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  39.77 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.02 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.04 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  39.77 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  35.63 
 
 		 264 aa  158  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  42.19 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  40.15 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.89 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.07 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.11 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.07 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  40.45 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.52 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.47 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  42.06 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.73 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  40.15 
 
 		 261 aa  154  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>