More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2496 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
431 aa  845    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  57.02 
 
 
256 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1468  GCN5-related N-acetyltransferase  59.78 
 
 
202 aa  194  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1312  GCN5-related N-acetyltransferase  58.05 
 
 
178 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.449601  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2080  GCN5-related N-acetyltransferase  50.54 
 
 
188 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4191  GCN5-related N-acetyltransferase  54.91 
 
 
205 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867003  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2790  GCN5-related N-acetyltransferase  49.08 
 
 
237 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0995  GCN5-related N-acetyltransferase  51.72 
 
 
179 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477492  normal  0.167483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34210  acetyltransferase  51.14 
 
 
179 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01975  acetyltransferase  51.74 
 
 
217 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0699749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3275  GCN5-related N-acetyltransferase  48.84 
 
 
171 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.668307 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1913  GCN5-related N-acetyltransferase  44.12 
 
 
182 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2266  acetyltransferase, GNAT family  44.12 
 
 
193 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2568  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
168 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0982  GCN5-related N-acetyltransferase  44.12 
 
 
176 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1695  acetyltransferase protein  34.8 
 
 
207 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1969  GCN5-related N-acetyltransferase  37.82 
 
 
212 aa  107  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
167 aa  107  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6930  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 
184 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07320  acetyltransferase  44.58 
 
 
190 aa  104  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1983  GCN5-related N-acetyltransferase  35.75 
 
 
199 aa  97.8  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00080154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
265 aa  93.2  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.2 
 
 
265 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
268 aa  87.4  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  34.84 
 
 
226 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.74 
 
 
262 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
271 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
275 aa  84  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.08 
 
 
270 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
270 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 
504 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  31.6 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  32.27 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
270 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  32.14 
 
 
298 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  29.15 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  28.41 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.17 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 
250 aa  77  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
284 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 
267 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  43.12 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  29.55 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  28.03 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
311 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  29.54 
 
 
296 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  30.2 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  28.75 
 
 
282 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
271 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  26.23 
 
 
266 aa  72  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  41.12 
 
 
272 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  28.51 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.49 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  27.18 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  41.82 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  28.94 
 
 
259 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.91 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
258 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  30.33 
 
 
259 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  39.02 
 
 
239 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
268 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
327 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
285 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
264 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>