117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2471 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  61.79 
 
 		 736 aa  708    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 719 aa  1369    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  44.18 
 
 		 678 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  44.24 
 
 		 692 aa  432  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  43.22 
 
 		 664 aa  432  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  40.43 
 
 		 651 aa  422  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.91 
 
 		 731 aa  415  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  40.96 
 
 		 691 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  43.52 
 
 		 681 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  43.03 
 
 		 651 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  40.23 
 
 		 687 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  43.33 
 
 		 679 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.95 
 
 		 675 aa  389  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  37.67 
 
 		 718 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  39.61 
 
 		 697 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  36.85 
 
 		 718 aa  379  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  40.61 
 
 		 722 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  39.85 
 
 		 708 aa  353  8e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  36.48 
 
 		 752 aa  342  2e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  38.78 
 
 		 665 aa  339  9e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  38.78 
 
 		 665 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  38.78 
 
 		 665 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  36.22 
 
 		 708 aa  337  5.999999999999999e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  39.15 
 
 		 711 aa  336  9e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  37.56 
 
 		 686 aa  333  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  39.54 
 
 		 672 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  39.3 
 
 		 676 aa  324  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  39.55 
 
 		 671 aa  323  6e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  35.77 
 
 		 687 aa  316  8e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  36.35 
 
 		 631 aa  312  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  33.83 
 
 		 739 aa  308  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  36.07 
 
 		 671 aa  290  6e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.17 
 
 		 683 aa  288  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  43.22 
 
 		 661 aa  255  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  45.87 
 
 		 632 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  34.12 
 
 		 646 aa  246  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  33.28 
 
 		 642 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  32.62 
 
 		 641 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  32.62 
 
 		 641 aa  225  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  42.76 
 
 		 310 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  32.67 
 
 		 637 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  46.25 
 
 		 319 aa  220  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  45.88 
 
 		 322 aa  217  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  46.24 
 
 		 322 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  42.76 
 
 		 328 aa  206  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  42.02 
 
 		 319 aa  206  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  39.05 
 
 		 654 aa  197  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  38.77 
 
 		 651 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  36.24 
 
 		 331 aa  158  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.75 
 
 		 613 aa  158  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  36.24 
 
 		 326 aa  157  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  36.24 
 
 		 331 aa  157  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  36.24 
 
 		 331 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  36.52 
 
 		 308 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  37.78 
 
 		 322 aa  155  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  30.14 
 
 		 653 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.52 
 
 		 307 aa  130  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  30.23 
 
 		 394 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  32.28 
 
 		 354 aa  122  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  30.57 
 
 		 387 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  28.03 
 
 		 327 aa  98.6  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  28.04 
 
 		 265 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  27.99 
 
 		 274 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  27.61 
 
 		 277 aa  94  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  27.61 
 
 		 277 aa  94  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  27.24 
 
 		 277 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  31.72 
 
 		 343 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  26.87 
 
 		 277 aa  90.5  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  31.33 
 
 		 254 aa  87  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  31.73 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  35.04 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.99 
 
 		 326 aa  69.7  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  34.44 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.01 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  27.3 
 
 		 604 aa  58.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  27.59 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  29.76 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.9 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.43 
 
 		 290 aa  55.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  39.66 
 
 		 869 aa  55.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  25.98 
 
 		 270 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  25.43 
 
 		 289 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3086  hypothetical protein  38.12 
 
 		 235 aa  52.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0589331  hitchhiker  0.00886483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.04 
 
 		 291 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  25.09 
 
 		 294 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  24.44 
 
 		 280 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.58 
 
 		 613 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  32.14 
 
 		 547 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  25.27 
 
 		 296 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.55 
 
 		 307 aa  49.7  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  25.21 
 
 		 290 aa  48.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  25.21 
 
 		 290 aa  48.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  25.21 
 
 		 290 aa  48.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  25.21 
 
 		 290 aa  48.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  25.21 
 
 		 290 aa  48.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  25.21 
 
 		 290 aa  48.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  28.44 
 
 		 549 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  28.44 
 
 		 547 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  25.93 
 
 		 265 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  27.15 
 
 		 322 aa  47.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>