239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2455 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 829 aa  1629    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  43.01 
 
 		 859 aa  501  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  40.98 
 
 		 900 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  41.73 
 
 		 897 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  41.64 
 
 		 992 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  40.86 
 
 		 899 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  45.83 
 
 		 675 aa  422  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  38.46 
 
 		 934 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  41.98 
 
 		 1000 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 911 aa  342  2e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  34.39 
 
 		 1056 aa  338  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  35.39 
 
 		 1309 aa  337  5.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  34.35 
 
 		 1324 aa  330  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 785 aa  321  3.9999999999999996e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  36.94 
 
 		 845 aa  317  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  34.98 
 
 		 1068 aa  317  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  40.16 
 
 		 686 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  34.12 
 
 		 963 aa  312  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  35.5 
 
 		 1500 aa  300  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  31.88 
 
 		 1314 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  32.82 
 
 		 838 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  34.01 
 
 		 1383 aa  265  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  32.88 
 
 		 843 aa  264  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  31.9 
 
 		 849 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  31.85 
 
 		 1311 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  34.22 
 
 		 801 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1523 aa  232  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  31.52 
 
 		 1509 aa  232  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.87 
 
 		 1424 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  40.32 
 
 		 385 aa  221  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1088 aa  208  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 1105 aa  205  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1039 aa  201  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1010 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  30.76 
 
 		 924 aa  183  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  31.85 
 
 		 713 aa  181  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 		 1262 aa  178  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  29.97 
 
 		 1326 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1404 aa  175  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  27.58 
 
 		 1125 aa  169  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  29.07 
 
 		 1261 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  30.27 
 
 		 1228 aa  167  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  26.88 
 
 		 1050 aa  167  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  26.93 
 
 		 857 aa  164  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 953 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  33.62 
 
 		 457 aa  160  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  27.37 
 
 		 672 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 767 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 		 1146 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  27.37 
 
 		 793 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 		 1128 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 		 1185 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  39.04 
 
 		 373 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.41 
 
 		 1288 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  24.52 
 
 		 1131 aa  141  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 814 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0706  tetratricopeptide TPR_4  48.44 
 
 		 234 aa  137  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.04 
 
 		 1186 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.36 
 
 		 2145 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  49.7 
 
 		 358 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1212 aa  132  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  35.78 
 
 		 828 aa  132  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 776 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1283 aa  131  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  38.64 
 
 		 284 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  25.3 
 
 		 680 aa  129  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 568 aa  127  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 		 577 aa  127  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 		 568 aa  127  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 843 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  23.65 
 
 		 822 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.47 
 
 		 1328 aa  120  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  25.3 
 
 		 1136 aa  120  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  38.63 
 
 		 837 aa  120  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 1215 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 454 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  35.11 
 
 		 1488 aa  112  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  31.11 
 
 		 847 aa  111  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  24.89 
 
 		 977 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  30.75 
 
 		 850 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 		 640 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 751 aa  107  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1550 aa  107  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  43.06 
 
 		 157 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  30.57 
 
 		 919 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  40.88 
 
 		 1901 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  35.51 
 
 		 715 aa  100  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  45.71 
 
 		 161 aa  98.6  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  44.19 
 
 		 540 aa  98.6  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 966 aa  98.2  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  35.51 
 
 		 702 aa  97.4  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  45.57 
 
 		 564 aa  96.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  48.28 
 
 		 405 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 469 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 481 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  35.85 
 
 		 304 aa  95.1  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  29 
 
 		 825 aa  93.6  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1355 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.28 
 
 		 787 aa  92.4  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  39.52 
 
 		 235 aa  91.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>