More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2448 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  100 
 
 
641 aa  1226    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  62.79 
 
 
833 aa  344  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  68.54 
 
 
865 aa  336  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  60.61 
 
 
721 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  58.65 
 
 
734 aa  307  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  56.2 
 
 
932 aa  292  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  56.85 
 
 
828 aa  288  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  55.85 
 
 
898 aa  281  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  55.39 
 
 
835 aa  276  9e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  56.09 
 
 
644 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  53.23 
 
 
806 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  52.09 
 
 
585 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  54.28 
 
 
729 aa  261  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  52.01 
 
 
611 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  55.04 
 
 
573 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  53.53 
 
 
520 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  52.13 
 
 
771 aa  252  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
589 aa  251  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
569 aa  250  7e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  46.74 
 
 
555 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8619  serine/threonine protein kinase  53.11 
 
 
560 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.31 
 
 
673 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  50.55 
 
 
612 aa  240  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  41.86 
 
 
421 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  51.66 
 
 
613 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  52.27 
 
 
624 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  52.67 
 
 
676 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  48.47 
 
 
481 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  47.46 
 
 
564 aa  233  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  46.64 
 
 
528 aa  232  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  49.04 
 
 
586 aa  230  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
624 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  54.37 
 
 
520 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  47.88 
 
 
569 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
652 aa  227  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  48.55 
 
 
604 aa  226  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  46.95 
 
 
644 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2614  serine/threonine protein kinase  44.48 
 
 
590 aa  226  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.25394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  48.26 
 
 
716 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  48.67 
 
 
608 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.77 
 
 
599 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.94 
 
 
673 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.33 
 
 
600 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0500  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.84 
 
 
490 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  46.59 
 
 
535 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.77 
 
 
814 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  47.06 
 
 
637 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  45.1 
 
 
548 aa  220  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  42.22 
 
 
544 aa  220  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  44.09 
 
 
547 aa  216  9e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2433  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
526 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.263911  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  51.88 
 
 
616 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.18 
 
 
481 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3185  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.94 
 
 
496 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.0794633 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  47.17 
 
 
587 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  47.53 
 
 
594 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  45.56 
 
 
695 aa  215  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.77 
 
 
557 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0669  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.96 
 
 
975 aa  214  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0315888  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  44.66 
 
 
571 aa  214  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
624 aa  213  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  45.52 
 
 
637 aa  212  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  45.28 
 
 
542 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
638 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5244  serine/threonine protein kinase  44.36 
 
 
601 aa  210  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2860  serine/threonine protein kinase  46.99 
 
 
780 aa  210  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  43.18 
 
 
360 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.31 
 
 
587 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  46.06 
 
 
680 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  43.96 
 
 
514 aa  208  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.06 
 
 
761 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.66 
 
 
608 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  43.07 
 
 
292 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  45.25 
 
 
630 aa  205  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0255  serine/threonine protein kinase  40.66 
 
 
754 aa  204  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0438219  normal  0.0628344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
542 aa  203  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  47.37 
 
 
694 aa  203  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  43.18 
 
 
603 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  45.86 
 
 
541 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4260  serine/threonine protein kinase  46.59 
 
 
551 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0338869  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.82 
 
 
751 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  48.97 
 
 
632 aa  201  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  42.97 
 
 
870 aa  201  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 
550 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.83 
 
 
1148 aa  200  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31690  protein kinase family protein  46.27 
 
 
643 aa  200  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7433  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.41 
 
 
664 aa  200  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.35 
 
 
716 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0360  serine/threonine protein kinase  47.91 
 
 
508 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  46.59 
 
 
646 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 
837 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0807  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.74 
 
 
1190 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  43.06 
 
 
522 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  43.3 
 
 
696 aa  198  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  41.22 
 
 
820 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  44.57 
 
 
560 aa  195  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.56 
 
 
1256 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.15 
 
 
687 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  44.32 
 
 
742 aa  194  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2849  serine/threonine protein kinase  47.51 
 
 
709 aa  194  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>