More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2246 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2246  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 407 aa  751    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14079  decreased coverage  0.00792288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1913  OmpA/MotB  49.75 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467087  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 		 218 aa  93.6  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  30.31 
 
 		 261 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  48.57 
 
 		 230 aa  89.7  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 440 aa  89.7  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  36.2 
 
 		 388 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  48.51 
 
 		 222 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  45.63 
 
 		 543 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  46.6 
 
 		 544 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  41.86 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.63 
 
 		 542 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  43.69 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  35.07 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  46.08 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  44.23 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  41.75 
 
 		 217 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  39.64 
 
 		 233 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  41.38 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  50 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  46 
 
 		 229 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  45.95 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  33.54 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  39.22 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  55.71 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  42 
 
 		 222 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  44.71 
 
 		 1026 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 222 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  39.1 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  51.19 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  51.43 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  36.03 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  42.57 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  45.45 
 
 		 609 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  55.56 
 
 		 607 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  43.56 
 
 		 227 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  37.25 
 
 		 214 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  39.1 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  40 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 210 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  35.82 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  39.38 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  38.75 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  31.1 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  40 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  40 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  38.24 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  34.68 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  38.75 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  44.44 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  39.81 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  43.43 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  38.75 
 
 		 263 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  40 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  40.59 
 
 		 221 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  40 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 209 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  40 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  40 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 217 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  27.4 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  47.89 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  40 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 224 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  27.21 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  37.19 
 
 		 658 aa  75.5  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  51.39 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  51.39 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  27.46 
 
 		 247 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  43.96 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  43.1 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  51.39 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  36.57 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  27.4 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>