More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2235 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2235  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 		 130 aa  251  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61872  decreased coverage  0.00557784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  70.67 
 
 		 228 aa  104  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  63.51 
 
 		 225 aa  97.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.51 
 
 		 227 aa  97.1  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  57.53 
 
 		 228 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.33 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  52 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  54.67 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 258 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.79 
 
 		 242 aa  77.8  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  60.34 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  55.56 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1342  ABC transporter related  50.65 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  55 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1886  ABC transporter related  43.02 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  45.21 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  39.62 
 
 		 297 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  43.96 
 
 		 266 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  39.6 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5010  ABC transporter related  45.83 
 
 		 352 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  34.95 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  53.33 
 
 		 355 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  53.33 
 
 		 355 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  53.33 
 
 		 355 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  44.16 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5137  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 352 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  53.33 
 
 		 355 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7230  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.15 
 
 		 355 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.983063  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  38.27 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  53.33 
 
 		 355 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  53.33 
 
 		 355 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  45.56 
 
 		 280 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  44.74 
 
 		 238 aa  67.4  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  55.74 
 
 		 253 aa  67  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  51.67 
 
 		 355 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0331  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.16 
 
 		 573 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00643219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  43.04 
 
 		 458 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3216  ABC transporter related  48.44 
 
 		 361 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3828  ABC transporter related  54.1 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0596278  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  36.63 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.63 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1851  ABC transporter related  36.71 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.201191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2869  ABC transporter related  48.44 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0665765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  45.59 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  49.33 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1484  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  45 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  51.52 
 
 		 749 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  45.16 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.19 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0328  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  47.76 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.785101 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  51.52 
 
 		 761 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  41.57 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  51.52 
 
 		 758 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  50.88 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  50.88 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  52.11 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  45.59 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2431  polar amino acid ABC transporter ATPase  49.18 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  50.88 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4160  ABC transporter related  45.95 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  51.61 
 
 		 355 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51.52 
 
 		 755 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51.52 
 
 		 752 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  51.52 
 
 		 746 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51.52 
 
 		 746 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0887  ABC transporter related  38.36 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000314613  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0090  ABC transporter related  41.27 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  37.08 
 
 		 359 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  52.54 
 
 		 381 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  44.93 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21470  amino acid ABC transporter, ATP binding component  41.89 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0028  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 628 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5190  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  47.06 
 
 		 352 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  45.21 
 
 		 445 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 		 355 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3482  ABC transporter related protein  49.23 
 
 		 384 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.815806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  36.99 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1173  ABC transporter related  57.38 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.470964  normal  0.243393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  52.54 
 
 		 333 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  35.44 
 
 		 255 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  40.3 
 
 		 240 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  36.25 
 
 		 248 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.36 
 
 		 255 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  46.05 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1133  polar amino acid ABC transporter ATPase  44.62 
 
 		 278 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4424  ABC transporter related  46.48 
 
 		 601 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.612186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  54.84 
 
 		 357 aa  64.7  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  40.28 
 
 		 286 aa  64.3  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  48.61 
 
 		 262 aa  63.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1614  ABC transporter related  49.25 
 
 		 244 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.045401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  47.83 
 
 		 264 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2939  ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 		 358 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.878604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1149  ABC transporter-related protein  42.65 
 
 		 240 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  45.16 
 
 		 253 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 269 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  50.7 
 
 		 291 aa  63.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6095  ABC transporter related  39.33 
 
 		 362 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.733778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>