60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2158 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  100 
 
 
587 aa  1165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  47.72 
 
 
680 aa  493  1e-138  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  33.79 
 
 
557 aa  221  2e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  33.85 
 
 
561 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  31.53 
 
 
541 aa  199  1e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  35.29 
 
 
545 aa  198  2e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  32.35 
 
 
550 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.12421e-12  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  29.25 
 
 
600 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  7.50178e-06 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  27.08 
 
 
651 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.2677e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  23.94 
 
 
651 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  27.45 
 
 
547 aa  159  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  30.08 
 
 
594 aa  149  1e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  29.56 
 
 
528 aa  147  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  31.4 
 
 
603 aa  142  1e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  31.16 
 
 
524 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  32.83 
 
 
617 aa  100  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  27.87 
 
 
627 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  27.81 
 
 
584 aa  98.2  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  27.62 
 
 
584 aa  97.8  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  28.14 
 
 
628 aa  97.8  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  24.25 
 
 
668 aa  95.5  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  28.92 
 
 
584 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  27.72 
 
 
584 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  29.06 
 
 
568 aa  88.2  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  27.69 
 
 
580 aa  86.3  2e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  26.09 
 
 
518 aa  85.5  3e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  27.29 
 
 
571 aa  84.3  5e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  27.47 
 
 
543 aa  84.3  6e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  27.47 
 
 
617 aa  84  8e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  28.35 
 
 
569 aa  80.9  5e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  26.74 
 
 
548 aa  80.1  9e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  28.61 
 
 
581 aa  79  2e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  26.18 
 
 
592 aa  79.3  2e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  26.51 
 
 
548 aa  78.6  3e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  27.07 
 
 
597 aa  78.6  3e-13  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  25.27 
 
 
569 aa  76.6  1e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  1.68541e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  27.97 
 
 
568 aa  74.7  4e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  20.5 
 
 
657 aa  74.3  5e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.0262e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  26.59 
 
 
610 aa  72.8  2e-11  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  26.29 
 
 
629 aa  71.6  4e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  8.59361e-08 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  26.46 
 
 
614 aa  70.1  1e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  20.53 
 
 
630 aa  69.7  1e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  5.00761e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  20.73 
 
 
627 aa  65.1  3e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  31.14 
 
 
570 aa  63.2  1e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  30 
 
 
570 aa  63.2  1e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  29.64 
 
 
570 aa  61.2  5e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  25.72 
 
 
581 aa  60.1  1e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  26.71 
 
 
702 aa  58.5  3e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  26.49 
 
 
702 aa  57.8  6e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  20.5 
 
 
896 aa  56.2  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  20.5 
 
 
908 aa  56.2  2e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  20.5 
 
 
896 aa  56.2  2e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  30.68 
 
 
702 aa  54.3  7e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  23.32 
 
 
634 aa  53.9  9e-06  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  24.44 
 
 
572 aa  52.4  2e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  24.41 
 
 
584 aa  52.4  2e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1388  hypothetical protein  22.34 
 
 
609 aa  51.6  4e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.210626 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  20.86 
 
 
670 aa  47  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3077  hypothetical protein  25.48 
 
 
712 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  25.93 
 
 
766 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>