More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2114 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1269  CBS  80.31 
 
 		 454 aa  661    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 484 aa  948    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  57.68 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  63.37 
 
 		 442 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  62.44 
 
 		 483 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  58.85 
 
 		 452 aa  448  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  60.33 
 
 		 434 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  62.84 
 
 		 425 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  56.6 
 
 		 426 aa  418  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  56.51 
 
 		 464 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  55.78 
 
 		 464 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  54.29 
 
 		 430 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  54.15 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  55.67 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  53.73 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  51.31 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  51.46 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  51.67 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  51.67 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  51.67 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  52.25 
 
 		 537 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  47.51 
 
 		 490 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  51.04 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  50.23 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  50 
 
 		 437 aa  342  7e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  49.07 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  51.89 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  44.37 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  46.95 
 
 		 443 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  44.98 
 
 		 447 aa  291  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  46.4 
 
 		 448 aa  282  9e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  36.25 
 
 		 420 aa  256  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  48.29 
 
 		 476 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  39.16 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  37.65 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  35.89 
 
 		 477 aa  230  4e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  38.69 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  31.78 
 
 		 429 aa  219  6e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  43.9 
 
 		 499 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  37.73 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  35.26 
 
 		 425 aa  209  8e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  33.59 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  33.58 
 
 		 421 aa  202  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  33.33 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  37.05 
 
 		 435 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  37.07 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  33.78 
 
 		 430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  35.63 
 
 		 446 aa  197  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  35.64 
 
 		 447 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  32.66 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  29.77 
 
 		 422 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  42.39 
 
 		 284 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  47.16 
 
 		 441 aa  192  8e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  30.39 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  45 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  32.55 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  30.9 
 
 		 443 aa  189  5.999999999999999e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  42.56 
 
 		 296 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  28.97 
 
 		 422 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  41.99 
 
 		 285 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  29.96 
 
 		 455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  33.33 
 
 		 442 aa  180  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  29.33 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  30.79 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  38.64 
 
 		 287 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  34.79 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  37.42 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  38.64 
 
 		 287 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  35.52 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  30.61 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  33.09 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  29.09 
 
 		 424 aa  177  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  29.06 
 
 		 468 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  28.64 
 
 		 448 aa  176  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  32.57 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  33.91 
 
 		 555 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  37.01 
 
 		 276 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  28.94 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  32.57 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  28.85 
 
 		 424 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  42.49 
 
 		 291 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  30 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  34.16 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  40.34 
 
 		 250 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  30.6 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  35.47 
 
 		 444 aa  171  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  38.37 
 
 		 285 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  30.91 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  40.73 
 
 		 284 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  38.78 
 
 		 286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  25.56 
 
 		 439 aa  167  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  29.84 
 
 		 487 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  31.75 
 
 		 420 aa  166  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  35.57 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  34.83 
 
 		 443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  35.09 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  39.09 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  37.88 
 
 		 293 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  30.17 
 
 		 446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>