127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2077 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2077  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  305  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398465  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  57.89 
 
 
340 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.43 
 
 
342 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.7 
 
 
319 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
347 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.88 
 
 
346 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.63 
 
 
351 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.63 
 
 
351 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.91 
 
 
325 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.75 
 
 
351 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.46 
 
 
352 aa  96.3  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.93 
 
 
346 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  42.72 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  37.72 
 
 
328 aa  81.3  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.66 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.34 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.34 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  41.35 
 
 
332 aa  78.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  39.62 
 
 
331 aa  77.8  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.8 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  34.51 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.54 
 
 
335 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 
348 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  36.63 
 
 
349 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 
349 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  37.36 
 
 
322 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  35.85 
 
 
343 aa  60.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  31.97 
 
 
346 aa  60.1  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
346 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
347 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.65 
 
 
348 aa  58.2  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  34.4 
 
 
347 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  31.68 
 
 
354 aa  57.4  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  31.62 
 
 
346 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  33.33 
 
 
346 aa  55.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.74 
 
 
354 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1506  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.84 
 
 
364 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185126  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  40 
 
 
334 aa  54.7  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 
322 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.31 
 
 
339 aa  53.9  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  33.64 
 
 
335 aa  53.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  30.84 
 
 
339 aa  51.2  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 
328 aa  51.2  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3829  hypothetical protein  31.25 
 
 
362 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.75 
 
 
347 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.24 
 
 
337 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1929  hypothetical protein  37.08 
 
 
365 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247381  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  33.33 
 
 
329 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  33.33 
 
 
329 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
329 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
329 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
329 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  33.33 
 
 
358 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
352 aa  48.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 
355 aa  48.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3842  hypothetical protein  34.83 
 
 
365 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  28.83 
 
 
337 aa  47.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  30.47 
 
 
342 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.36 
 
 
373 aa  47.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466913 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  34.44 
 
 
329 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
294 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
332 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 
313 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 
312 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
313 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
296 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.18 
 
 
347 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
306 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.03 
 
 
343 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.24 
 
 
330 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  30.69 
 
 
363 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  30.69 
 
 
363 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 
311 aa  44.7  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 
309 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  30.19 
 
 
336 aa  44.3  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 
361 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  30.59 
 
 
328 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 
411 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
311 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
363 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
313 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
317 aa  43.9  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 
312 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 
439 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
315 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
306 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
333 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
370 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
357 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 
336 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08583  aldehyde reductase II (AFU_orthologue; AFUA_1G11360)  29.09 
 
 
341 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.835406  normal  0.302961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.21 
 
 
336 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  29.63 
 
 
349 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.25 
 
 
347 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
368 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.96 
 
 
314 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
297 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
313 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  34.12 
 
 
329 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  34.12 
 
 
329 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>