More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2033 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 775 aa  1532    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0211  N-6 DNA methylase  32.7 
 
 		 712 aa  215  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  30.02 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.07 
 
 		 503 aa  202  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  29.95 
 
 		 501 aa  195  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  29.7 
 
 		 501 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.01 
 
 		 497 aa  194  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  34.49 
 
 		 544 aa  194  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  32.53 
 
 		 498 aa  193  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  33.88 
 
 		 519 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.53 
 
 		 549 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  31.2 
 
 		 525 aa  191  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  31.2 
 
 		 525 aa  191  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  32.57 
 
 		 518 aa  191  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  29.01 
 
 		 510 aa  190  7e-47  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.44 
 
 		 538 aa  189  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  34.83 
 
 		 541 aa  189  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  34.07 
 
 		 576 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  33.18 
 
 		 517 aa  187  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  33.25 
 
 		 517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  31.85 
 
 		 518 aa  184  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  34.05 
 
 		 540 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  34.18 
 
 		 520 aa  183  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  35.05 
 
 		 564 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  32.59 
 
 		 540 aa  182  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  30.79 
 
 		 535 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  30.93 
 
 		 528 aa  182  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  35.6 
 
 		 523 aa  179  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  32.37 
 
 		 544 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  30.59 
 
 		 544 aa  178  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  33.98 
 
 		 532 aa  177  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  31.18 
 
 		 540 aa  177  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  33.02 
 
 		 515 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 521 aa  176  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  32.08 
 
 		 511 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  33.18 
 
 		 548 aa  174  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  30.27 
 
 		 500 aa  174  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  33.25 
 
 		 543 aa  174  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  34.69 
 
 		 514 aa  171  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  33.02 
 
 		 519 aa  171  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  29 
 
 		 505 aa  170  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  29.93 
 
 		 527 aa  168  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  29.11 
 
 		 494 aa  168  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  30.24 
 
 		 567 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  31.35 
 
 		 540 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  34.62 
 
 		 527 aa  163  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  28.68 
 
 		 539 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  26.53 
 
 		 568 aa  161  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  27.4 
 
 		 567 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  28.68 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0022  N-6 DNA methylase  31.29 
 
 		 495 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0030  N-6 DNA methylase  31.29 
 
 		 495 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0191758 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  27.93 
 
 		 529 aa  158  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  28.12 
 
 		 501 aa  158  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  28.1 
 
 		 814 aa  157  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 493 aa  156  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  27.25 
 
 		 529 aa  156  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  30.9 
 
 		 499 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  28.19 
 
 		 570 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  30.2 
 
 		 506 aa  151  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.81 
 
 		 587 aa  151  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.13 
 
 		 517 aa  150  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  29.97 
 
 		 495 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  30.79 
 
 		 526 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  32.18 
 
 		 574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  30.51 
 
 		 569 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  34.49 
 
 		 808 aa  148  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1221  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.86 
 
 		 533 aa  147  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  28.12 
 
 		 508 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  29.76 
 
 		 499 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  31.23 
 
 		 585 aa  145  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  28.21 
 
 		 815 aa  144  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  26.95 
 
 		 527 aa  144  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  30.37 
 
 		 809 aa  144  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  31.45 
 
 		 537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  24.14 
 
 		 629 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  30.52 
 
 		 527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  28.52 
 
 		 633 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  36.75 
 
 		 860 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  28.29 
 
 		 871 aa  141  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  27.83 
 
 		 810 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  32.18 
 
 		 574 aa  141  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  25.52 
 
 		 810 aa  141  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  29.97 
 
 		 891 aa  140  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  31.17 
 
 		 574 aa  140  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  28.14 
 
 		 518 aa  140  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  28.24 
 
 		 808 aa  140  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1303  N-6 DNA methylase  28.12 
 
 		 529 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  27 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  27.8 
 
 		 505 aa  139  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  30.48 
 
 		 508 aa  138  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  30.48 
 
 		 523 aa  138  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  30.37 
 
 		 511 aa  138  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  27.78 
 
 		 873 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  31.03 
 
 		 526 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  30.23 
 
 		 799 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  30.62 
 
 		 504 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2329  N-6 DNA methylase  28.71 
 
 		 538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  26.46 
 
 		 814 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  32.2 
 
 		 822 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>