127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1982 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  608  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  56.49 
 
 		 567 aa  342  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  56.49 
 
 		 426 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  59.35 
 
 		 443 aa  318  7.999999999999999e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  58.06 
 
 		 443 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  44.33 
 
 		 510 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  32.41 
 
 		 516 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  30.59 
 
 		 508 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  29.43 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  30.22 
 
 		 551 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  30.42 
 
 		 556 aa  99  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  29.47 
 
 		 499 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  28.88 
 
 		 580 aa  97.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  30.79 
 
 		 512 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  27.33 
 
 		 535 aa  92.8  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  44.74 
 
 		 628 aa  92.8  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  28.48 
 
 		 507 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  46.46 
 
 		 748 aa  92.8  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  30.14 
 
 		 426 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  44.74 
 
 		 605 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  43.86 
 
 		 580 aa  86.3  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  43.86 
 
 		 584 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  43.86 
 
 		 558 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  30.25 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  28.85 
 
 		 403 aa  82.4  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  28.1 
 
 		 568 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  32.4 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  29.07 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  30.1 
 
 		 430 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  30.1 
 
 		 430 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  28.61 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  29.57 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  29.57 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  30.34 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  27.06 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  31.03 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  31.03 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  27.97 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  26.36 
 
 		 535 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  27.24 
 
 		 566 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  42.15 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  41.23 
 
 		 714 aa  75.9  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  28.9 
 
 		 410 aa  75.9  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  27.04 
 
 		 620 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  28.31 
 
 		 545 aa  75.9  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  29.75 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  40.94 
 
 		 637 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  28.57 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  27.87 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  42.98 
 
 		 502 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  27.74 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  34.72 
 
 		 469 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  26.42 
 
 		 603 aa  73.2  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  27.94 
 
 		 498 aa  73.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  42.98 
 
 		 602 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  28.43 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  27.15 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  30.38 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  26.33 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  26.33 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  29.07 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  27.78 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  32.38 
 
 		 547 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  29.07 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  29.07 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  26.55 
 
 		 589 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  25.51 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  25.6 
 
 		 567 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  24.24 
 
 		 585 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  42.98 
 
 		 553 aa  66.6  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  27.05 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  29.07 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  41.23 
 
 		 169 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  28 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  33.33 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  32.12 
 
 		 485 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  30.04 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  32.9 
 
 		 441 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  26.79 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  28.14 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 565 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  27.51 
 
 		 561 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  39.81 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  28.08 
 
 		 541 aa  59.3  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  35 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  35.04 
 
 		 521 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  37.19 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  29.79 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  26.64 
 
 		 466 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  26.06 
 
 		 464 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  25.3 
 
 		 475 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  26.97 
 
 		 555 aa  53.1  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  45.71 
 
 		 620 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  29.62 
 
 		 472 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  34.92 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  31.65 
 
 		 408 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  34.74 
 
 		 661 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  30.82 
 
 		 391 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  35.19 
 
 		 620 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>