More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1969 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 568 aa  1093    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  65.15 
 
 		 588 aa  624  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.2 
 
 		 580 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  54.69 
 
 		 592 aa  504  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  49.37 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  50.36 
 
 		 591 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.37 
 
 		 567 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 571 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.56 
 
 		 566 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  47.28 
 
 		 573 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 		 573 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 		 565 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 595 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.71 
 
 		 566 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  42.48 
 
 		 577 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  43.97 
 
 		 578 aa  362  8e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 		 559 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 		 579 aa  355  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 568 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 568 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 631 aa  354  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 568 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 566 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 566 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 566 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 		 575 aa  350  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 578 aa  341  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 556 aa  339  7e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.47 
 
 		 544 aa  333  6e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  41.79 
 
 		 536 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  40.77 
 
 		 573 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 		 543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  37.91 
 
 		 549 aa  284  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  39.39 
 
 		 543 aa  280  7e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 535 aa  276  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 535 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 525 aa  274  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 590 aa  258  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 571 aa  243  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 550 aa  219  7.999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  39.14 
 
 		 401 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  35.99 
 
 		 391 aa  176  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  49.5 
 
 		 392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  31.39 
 
 		 635 aa  163  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 381 aa  163  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.51 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  35.98 
 
 		 828 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  34.93 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  34.36 
 
 		 851 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 372 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 386 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 725 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  39.11 
 
 		 484 aa  120  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32 
 
 		 594 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  34.37 
 
 		 795 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1849  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.34 
 
 		 603 aa  103  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.31 
 
 		 593 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2522  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.31 
 
 		 380 aa  102  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.31 
 
 		 593 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  30.25 
 
 		 673 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 665 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  39.2 
 
 		 338 aa  97.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  38.67 
 
 		 373 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2317  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.04 
 
 		 598 aa  96.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 682 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 345 aa  95.1  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 682 aa  94.7  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 351 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 351 aa  94.7  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 351 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 351 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 351 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2261  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.93 
 
 		 602 aa  94.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0999245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 344 aa  94.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  32.35 
 
 		 382 aa  94.4  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2567  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.51 
 
 		 623 aa  93.6  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 775 aa  93.6  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 351 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 351 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  27.86 
 
 		 351 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 591 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  29.17 
 
 		 598 aa  92  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  29.17 
 
 		 598 aa  92  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.17 
 
 		 598 aa  92  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  29.17 
 
 		 598 aa  92  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.17 
 
 		 598 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.17 
 
 		 598 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.17 
 
 		 598 aa  92  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  32.22 
 
 		 643 aa  91.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 545 aa  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.17 
 
 		 598 aa  92  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 393 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1767  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.1 
 
 		 604 aa  91.7  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 544 aa  90.5  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 351 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1005  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  31.23 
 
 		 644 aa  90.5  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 351 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>