151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1942 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  698    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  44.57 
 
 		 424 aa  242  7.999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  37.15 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  37.29 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  38.96 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  35.86 
 
 		 289 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  33.92 
 
 		 284 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  35.37 
 
 		 293 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  33.92 
 
 		 284 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  33.92 
 
 		 284 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0572  hypothetical protein  39.9 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  38 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5594  hypothetical protein  34.63 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.738395  normal  0.042079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  34.41 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  32.29 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  34.02 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  34.02 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  34.02 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0205  hypothetical protein  30.63 
 
 		 197 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  30.81 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0527  hypothetical protein  32.1 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0459714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  33.2 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  33.63 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  31.33 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  32.14 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  32.86 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  32.86 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  32.86 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  32 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  27.33 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  30.52 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  40.24 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2924  hypothetical protein  29.09 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  34.78 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  28.8 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  33.49 
 
 		 291 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  35.18 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  39.63 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  39.63 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  31.42 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  42.86 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  31.82 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  31.82 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  34.08 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  28.4 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  34.08 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  32.94 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  33.02 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  32.65 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  30.77 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  34.44 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  31.71 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  33.9 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  31.32 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  31.32 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  31.22 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  30.04 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  34.75 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  41.33 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  34.27 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  32.39 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  36.46 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4023  hypothetical protein  29.66 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.414185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  27.25 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  31.73 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  32.97 
 
 		 304 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  31.33 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  31.33 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  31.07 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  37.79 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  33.94 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  34.18 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  30.89 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  32.77 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  31.76 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  31.76 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  32.81 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  36.16 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  28.67 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  27.89 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  37.21 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  37.21 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  31.79 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  31.82 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  34.76 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  36.59 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  29.41 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  29.8 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1237  hypothetical protein  33.99 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  31.62 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  31.98 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  31.98 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  31.98 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  31.22 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  31.9 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  30.86 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  33.92 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  27.27 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>