37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1906 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1906  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
92 aa  185  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1606  phosphopantetheine-binding  69.62 
 
 
85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5324  beta-ketoacyl synthase  36.11 
 
 
897 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3405  phosphopantetheine-binding  31.71 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439455  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1157  putative polyketide synthase subunit  32 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2948  amino acid adenylation domain-containing protein  37.5 
 
 
1057 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.735724  normal  0.0141341 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2785  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  32 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2939  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  32 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0215  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
1759 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  36 
 
 
1876 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17510  phosphopantetheine-containing protein  35.44 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  35.14 
 
 
1828 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  30 
 
 
1704 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.06 
 
 
4478 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4216  amino acid adenylation domain-containing protein  38 
 
 
568 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5327  phosphopantetheine-binding  31.25 
 
 
107 aa  44.3  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  36.67 
 
 
2543 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
1474 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1666  polyketide synthase, putative  38.18 
 
 
5566 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  31.82 
 
 
1835 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0280  polyketide synthase, putative  31.43 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  46 
 
 
1296 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  28.38 
 
 
1208 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5619  polyketide synthase  31.17 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00123968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  33.33 
 
 
2225 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4321  Acyl transferase  40 
 
 
1042 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  28 
 
 
1939 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  46.67 
 
 
1497 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  32 
 
 
2333 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  29.07 
 
 
5802 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  33.33 
 
 
2499 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  33.33 
 
 
4048 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2782  Beta-ketoacyl synthase  44 
 
 
899 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0331764  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  29.17 
 
 
2791 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5290  erythronolide synthase, 6-methylsalicylic acid synthase  28.77 
 
 
4429 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  31.82 
 
 
6876 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02064  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  28.4 
 
 
1038 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>