More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1869 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  100 
 
 		 716 aa  1397    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  52.21 
 
 		 737 aa  635  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0242  serine/threonine protein kinase  69.58 
 
 		 295 aa  324  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6773  serine/threonine protein kinase  61.15 
 
 		 518 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  51.52 
 
 		 405 aa  309  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  54.46 
 
 		 919 aa  302  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.76 
 
 		 740 aa  291  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.38 
 
 		 1557 aa  280  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  49.52 
 
 		 1344 aa  279  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.71 
 
 		 682 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  49.21 
 
 		 540 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.2 
 
 		 1240 aa  275  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  50.67 
 
 		 892 aa  273  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 863 aa  268  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.7 
 
 		 642 aa  264  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  41.81 
 
 		 461 aa  265  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  49.06 
 
 		 1357 aa  260  7e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  50.47 
 
 		 675 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  54.79 
 
 		 772 aa  256  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.31 
 
 		 828 aa  252  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.43 
 
 		 676 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  45.43 
 
 		 652 aa  251  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  50.14 
 
 		 719 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 		 687 aa  238  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  51.94 
 
 		 807 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.65 
 
 		 692 aa  235  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  41.35 
 
 		 1789 aa  235  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  43.23 
 
 		 947 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  45.2 
 
 		 696 aa  229  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 1221 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  44.38 
 
 		 1163 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  50.16 
 
 		 770 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  43.12 
 
 		 1363 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  45.43 
 
 		 1364 aa  223  8e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  45.33 
 
 		 732 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  46.15 
 
 		 1217 aa  220  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.07 
 
 		 865 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  41.85 
 
 		 1652 aa  218  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  46.6 
 
 		 1443 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.74 
 
 		 698 aa  217  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  52.84 
 
 		 756 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.85 
 
 		 930 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  43.14 
 
 		 1236 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  37.71 
 
 		 1211 aa  212  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.44 
 
 		 1686 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  40.77 
 
 		 1193 aa  210  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  37.12 
 
 		 657 aa  209  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  40.82 
 
 		 1196 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.63 
 
 		 842 aa  207  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4910  serine/threonine protein kinase  41 
 
 		 552 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104206  decreased coverage  0.00224255 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.55 
 
 		 682 aa  203  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.4 
 
 		 833 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.56 
 
 		 630 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  41.67 
 
 		 1523 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  42.01 
 
 		 1661 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  39.33 
 
 		 924 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  41.94 
 
 		 434 aa  201  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  37.82 
 
 		 1247 aa  200  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  38.66 
 
 		 1599 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  44.31 
 
 		 1334 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  41.64 
 
 		 1474 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  39.35 
 
 		 1553 aa  196  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.53 
 
 		 1267 aa  195  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  38.2 
 
 		 1190 aa  193  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  39.74 
 
 		 1510 aa  193  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.78 
 
 		 1481 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  40.19 
 
 		 1878 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.28 
 
 		 677 aa  191  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.39 
 
 		 1711 aa  190  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.51 
 
 		 1760 aa  190  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1367 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.39 
 
 		 1607 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.32 
 
 		 1398 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  36.26 
 
 		 1188 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.75 
 
 		 576 aa  185  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  40.84 
 
 		 1714 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.82 
 
 		 664 aa  184  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  44.97 
 
 		 850 aa  183  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  39.49 
 
 		 335 aa  183  9.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.81 
 
 		 733 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  33.53 
 
 		 1868 aa  181  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.03 
 
 		 1583 aa  180  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.3 
 
 		 1609 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  38.06 
 
 		 1242 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  36.01 
 
 		 1177 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.49 
 
 		 1598 aa  178  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  35.18 
 
 		 1552 aa  178  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  39.3 
 
 		 1454 aa  178  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.26 
 
 		 1547 aa  177  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  38.66 
 
 		 1176 aa  177  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  45.08 
 
 		 742 aa  176  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  35.18 
 
 		 1213 aa  177  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  35.56 
 
 		 1858 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  42.04 
 
 		 344 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  41.67 
 
 		 344 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  34.07 
 
 		 1348 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  39.93 
 
 		 1411 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  38.31 
 
 		 1831 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  35.02 
 
 		 317 aa  172  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  44.53 
 
 		 790 aa  171  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>