42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1826 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1826  LOR/SDH bifunctional protein  100 
 
 		 411 aa  821    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.263588  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3091  LOR/SDH bifunctional enzyme region  78.05 
 
 		 414 aa  648    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3107  LOR/SDH bifunctional protein  61.02 
 
 		 435 aa  488  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4864  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  57.91 
 
 		 412 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2163  hypothetical protein  45.16 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106153  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2149  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  41.16 
 
 		 440 aa  322  7e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1445  LOR/SDH bifunctional protein  41.28 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0636  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  40.61 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0938  hypothetical protein  38.31 
 
 		 409 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.182607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0686  hypothetical protein  42.3 
 
 		 409 aa  300  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0465  LOR/SDH bifunctional protein  38.06 
 
 		 415 aa  292  7e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1454  LOR/SDH bifunctional protein  37.81 
 
 		 415 aa  292  7e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0372  LOR/SDH bifunctional protein  38.46 
 
 		 415 aa  292  8e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216176  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0863  LOR/SDH bifunctional protein  37.87 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00957303 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1342  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  39.71 
 
 		 408 aa  289  6e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0795325  normal  0.948696 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0533  LOR/SDH bifunctional protein  36.82 
 
 		 415 aa  288  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.990735  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0845  LOR/SDH bifunctional protein  36.01 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1684  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  41.08 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0305327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0299  LOR/SDH bifunctional protein  40.35 
 
 		 410 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2692  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  40.78 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1408  LOR/SDH bifunctional protein  38.77 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000543179  normal  0.449844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  36.61 
 
 		 703 aa  273  6e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1005  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  38.85 
 
 		 419 aa  265  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.538878  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  35.94 
 
 		 705 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  35.84 
 
 		 704 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  35.7 
 
 		 705 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  35.8 
 
 		 703 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  36.25 
 
 		 705 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  34.73 
 
 		 703 aa  249  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1451  hypothetical protein  35.24 
 
 		 372 aa  179  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.553711  normal  0.492787 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05900  hypothetical protein  33.63 
 
 		 363 aa  172  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.598804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0121  hypothetical protein  33.68 
 
 		 420 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0554  hypothetical protein  33.93 
 
 		 380 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1885  hypothetical protein  34.71 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2325  hypothetical protein  34.64 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2463  hypothetical protein  52.66 
 
 		 431 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0048  hypothetical protein  34.47 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2787  hypothetical protein  34.12 
 
 		 364 aa  142  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4880  hypothetical protein  30.98 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2488  hypothetical protein  32.75 
 
 		 363 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.492113  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0025  hypothetical protein  31.86 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0026  hypothetical protein  25.14 
 
 		 367 aa  107  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>