More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1764 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3838  threonyl-tRNA synthetase  66.35 
 
 
695 aa  860    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.400381  normal  0.082381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3188  threonyl-tRNA synthetase  70.3 
 
 
690 aa  902    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1979  threonyl-tRNA synthetase  65.93 
 
 
671 aa  871    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000566637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13900  threonyl-tRNA synthetase  65.42 
 
 
666 aa  901    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  65.04 
 
 
669 aa  888    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000086336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
658 aa  1342    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2281  threonyl-tRNA synthetase  65.46 
 
 
684 aa  852    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  65.65 
 
 
682 aa  882    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1783  threonyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 
671 aa  831    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.491934  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3066  threonyl-tRNA synthetase  69.67 
 
 
656 aa  897    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.408536  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1783  threonyl-tRNA synthetase  67.17 
 
 
670 aa  896    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.0885436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1770  threonyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 
671 aa  827    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0365193  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1656  threonyl-tRNA synthetase  60.93 
 
 
672 aa  786    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  71.36 
 
 
659 aa  945    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  72.91 
 
 
659 aa  979    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  74.26 
 
 
657 aa  1001    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  63.8 
 
 
676 aa  879    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10670  threonyl-tRNA synthetase  65.85 
 
 
672 aa  880    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000327769  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  62.93 
 
 
677 aa  887    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  72.15 
 
 
657 aa  1003    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3442  threonyl-tRNA synthetase  66.97 
 
 
699 aa  863    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000446012  hitchhiker  0.0000744788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14910  threonyl-tRNA synthetase  65.96 
 
 
692 aa  885    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  87.73 
 
 
701 aa  1184    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2287  threonyl-tRNA synthetase  67.3 
 
 
691 aa  866    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12385  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15440  threonyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 
660 aa  809    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.374739  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17410  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  66.82 
 
 
676 aa  887    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.595758  normal  0.0835389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1919  threonyl-tRNA synthetase  65.41 
 
 
677 aa  852    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.615568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  69.35 
 
 
684 aa  951    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12633  threonyl-tRNA synthetase  63.43 
 
 
692 aa  843    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167606  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2392  threonyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 
668 aa  879    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451072  hitchhiker  0.00797277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2242  threonyl-tRNA synthetase  65.46 
 
 
684 aa  852    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  74.62 
 
 
666 aa  1020    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2317  threonyl-tRNA synthetase  65.8 
 
 
669 aa  898    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104069  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1378  threonyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 
673 aa  879    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0410171  normal  0.0241813 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1358  threonyl-tRNA synthetase  70.48 
 
 
685 aa  941    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.462189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2370  threonyl-tRNA synthetase  63.58 
 
 
668 aa  875    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2289  threonyl-tRNA synthetase  65.46 
 
 
684 aa  852    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45784  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2558  threonyl-tRNA synthetase  65.77 
 
 
691 aa  855    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
648 aa  630  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 
646 aa  598  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
636 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
636 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
645 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
643 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
645 aa  588  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
636 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 
644 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 
644 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
644 aa  580  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
636 aa  581  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
649 aa  581  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
644 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
638 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
581 aa  575  1.0000000000000001e-163  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
604 aa  572  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
644 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
643 aa  568  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
614 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
583 aa  558  1e-158  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
644 aa  558  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
638 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
659 aa  558  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
633 aa  552  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1229  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
623 aa  553  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
644 aa  548  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
637 aa  548  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
644 aa  548  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
635 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
611 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
639 aa  545  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
611 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
635 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
582 aa  536  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  46.08 
 
 
582 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
596 aa  536  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
595 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
582 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
638 aa  535  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
641 aa  533  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
639 aa  534  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
637 aa  531  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
595 aa  529  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
634 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
608 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
647 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
637 aa  526  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
635 aa  527  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
634 aa  528  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
662 aa  525  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0641  threonyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
658 aa  523  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
648 aa  522  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
648 aa  524  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
638 aa  519  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
594 aa  520  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1638  threonyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
660 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360122  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
640 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
608 aa  517  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
640 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
607 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
636 aa  512  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>