95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1760 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  100 
 
 
227 aa  447  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  71.18 
 
 
226 aa  317  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  72.27 
 
 
223 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  78.54 
 
 
243 aa  311  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  67.69 
 
 
232 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  73.54 
 
 
221 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  64.38 
 
 
222 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  63.47 
 
 
231 aa  271  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  64.41 
 
 
225 aa  258  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  58.62 
 
 
232 aa  258  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  64.44 
 
 
231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  58.19 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  56.34 
 
 
222 aa  211  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  44.55 
 
 
229 aa  165  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  42.22 
 
 
229 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  38.81 
 
 
223 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  41.63 
 
 
225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  36.77 
 
 
222 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  38.01 
 
 
223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  42.27 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  36.99 
 
 
223 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  41.63 
 
 
222 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.09 
 
 
222 aa  122  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  34.98 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  34.98 
 
 
226 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  37.14 
 
 
220 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.75 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  32.51 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  39.82 
 
 
244 aa  108  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  44.34 
 
 
223 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  37.02 
 
 
222 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  35.24 
 
 
222 aa  98.2  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  38.81 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  39.07 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  32.26 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  31.28 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.79 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.03 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  33.33 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  34.18 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.72 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  36.06 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.66 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.81 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  34.13 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  34.01 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  27.14 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.84 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.96 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  38.93 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.39 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  34.13 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  32.14 
 
 
208 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.83 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.81 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.55 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  28.21 
 
 
188 aa  59.3  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.88 
 
 
216 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  32.82 
 
 
218 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.72 
 
 
206 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  30.81 
 
 
236 aa  55.5  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.92 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.45 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.12 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  28.26 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.41 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.38 
 
 
209 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.52 
 
 
222 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.46 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  28.65 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  28.95 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30 
 
 
202 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.06 
 
 
223 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.91 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  25.28 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.43 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  27.97 
 
 
439 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.69 
 
 
316 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.9 
 
 
248 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.25 
 
 
259 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  27.12 
 
 
443 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32 
 
 
236 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.26 
 
 
251 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  38.61 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4570  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.26 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.69 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.7 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  28.42 
 
 
447 aa  42.7  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.36 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2292  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
174 aa  42  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.56 
 
 
201 aa  42  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.72 
 
 
257 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  25.83 
 
 
443 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>