177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1742 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  100 
 
 		 189 aa  361  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  84.89 
 
 		 234 aa  226  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  56.02 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  57.32 
 
 		 180 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  54.17 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  52.3 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 184 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  57.5 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  53.98 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  52.05 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  54.55 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  54.12 
 
 		 167 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  58.33 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  58.33 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  54.09 
 
 		 164 aa  147  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  54.6 
 
 		 175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  58.99 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  56.76 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  49.72 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  57.24 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  52.94 
 
 		 178 aa  144  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  57.34 
 
 		 176 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  51.9 
 
 		 171 aa  144  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  54.86 
 
 		 168 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  50 
 
 		 195 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  54.66 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  52.49 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  53.66 
 
 		 172 aa  141  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  50.99 
 
 		 177 aa  137  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  54.37 
 
 		 171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  50.96 
 
 		 161 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  52.98 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  57.25 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  49.11 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  47.8 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3067  arginine repressor, ArgR  52.8 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0811  Arginine repressor  39.13 
 
 		 170 aa  107  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.142208  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  46.04 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  43.51 
 
 		 152 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  37.72 
 
 		 200 aa  100  9e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 153 aa  98.6  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  35.58 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  38.52 
 
 		 150 aa  94.4  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  38.41 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  40.74 
 
 		 150 aa  93.2  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  33.97 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  38.52 
 
 		 150 aa  93.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  33.97 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  33.97 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  33.97 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  33.97 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  33.97 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  33.97 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  33.97 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  33.97 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  33.97 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  36.03 
 
 		 150 aa  91.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  36.03 
 
 		 150 aa  91.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  35.26 
 
 		 149 aa  91.7  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  32.9 
 
 		 149 aa  91.3  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  38.81 
 
 		 150 aa  91.3  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  40.74 
 
 		 145 aa  89  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  33.33 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 161 aa  88.2  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  31.58 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  36.84 
 
 		 141 aa  86.3  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  85.1  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  36.09 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  31.85 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  44.27 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  31.85 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  35.29 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  41.04 
 
 		 148 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  32.86 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  45.67 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  45.67 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  37.4 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1045  arginine repressor  39.85 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.775166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  35.34 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0448  ArgR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4864  arginine repressor ArgR  37.6 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4808  arginine repressor ArgR  37.6 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.777034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4844  arginine repressor ArgR  37.6 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4745  arginine repressor, ArgR  37.6 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  28.95 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4714  arginine repressor, ArgR  37.6 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371163  normal  0.633002 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  36.57 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  30.37 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0825  arginine repressor  36.36 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000490161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  32.37 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  36.09 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  35.46 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  31.11 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  31.11 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  30.37 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  31.58 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>