40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1726 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1726  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1009    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0145734  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  60.07 
 
 
659 aa  287  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  30.73 
 
 
405 aa  103  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  32.14 
 
 
759 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  31.2 
 
 
771 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  29.8 
 
 
639 aa  91.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  29.92 
 
 
388 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  29.92 
 
 
388 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  29.92 
 
 
388 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.6 
 
 
412 aa  87.4  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  28.79 
 
 
425 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  28.64 
 
 
478 aa  84  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  27.46 
 
 
362 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  30.47 
 
 
364 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  27.76 
 
 
665 aa  78.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.35 
 
 
698 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  26.53 
 
 
619 aa  76.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  29.66 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 
811 aa  74.7  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  25.2 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  25.82 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  28.17 
 
 
495 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  30.08 
 
 
346 aa  67  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.64 
 
 
542 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  26.8 
 
 
343 aa  65.1  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  29.1 
 
 
330 aa  63.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  29.66 
 
 
455 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  29.11 
 
 
463 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  27.49 
 
 
1132 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  29.41 
 
 
968 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  27.78 
 
 
926 aa  53.9  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  27.78 
 
 
666 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  26.1 
 
 
1160 aa  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  29.7 
 
 
487 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  29.13 
 
 
380 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  27 
 
 
475 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  27 
 
 
475 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  27 
 
 
475 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  23.4 
 
 
552 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.02 
 
 
334 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>