More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1723 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 227 aa  440  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 238 aa  286  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  59.82 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  59.28 
 
 		 202 aa  221  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  57.99 
 
 		 202 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  55.91 
 
 		 201 aa  211  9e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  55.31 
 
 		 217 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  59.36 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  57.27 
 
 		 220 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  55.31 
 
 		 205 aa  208  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  54.75 
 
 		 203 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  54.75 
 
 		 203 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  54.75 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  54.75 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  54.3 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  56.62 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  57.92 
 
 		 199 aa  204  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  55.91 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  53.88 
 
 		 203 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  56.89 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  53.88 
 
 		 205 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  54.26 
 
 		 215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  53.81 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  52.51 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  46.12 
 
 		 218 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 226 aa  187  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  51.12 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  51.34 
 
 		 210 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  48.4 
 
 		 215 aa  185  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  52.68 
 
 		 204 aa  184  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 215 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  50.23 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  49.77 
 
 		 196 aa  175  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  49.34 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 221 aa  174  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  52.97 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  48.9 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  44.29 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  43.95 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  42.99 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  38.91 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  45.21 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  43.18 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  45.74 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  42.22 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  41.55 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  42.22 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  42.73 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  43.06 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  39.55 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  41.44 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  38.01 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 214 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  44.55 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  41.52 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  44.29 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  45 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  42.59 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  43.89 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  38.01 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  44.09 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  49.09 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  44.29 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  44.29 
 
 		 205 aa  154  8e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  42.92 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04231  riboflavin synthase, alpha subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G06240)  41.59 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.126635  normal  0.37448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  43.05 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  43.44 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  41.82 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 187 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0681  riboflavin synthase, alpha subunit  42.67 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0301  riboflavin synthase subunit alpha  45.29 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 208 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  45.25 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3109  riboflavin synthase subunit alpha  43.11 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  42.36 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  42.53 
 
 		 192 aa  148  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>