More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1720 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 495 aa  937    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  70.96 
 
 		 491 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.92 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  51.44 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  53.61 
 
 		 515 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  50.91 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  52.6 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  51.02 
 
 		 489 aa  365  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  54.71 
 
 		 478 aa  363  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  52.06 
 
 		 476 aa  363  4e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.19 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.18 
 
 		 462 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.75 
 
 		 509 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  52.97 
 
 		 471 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  52.39 
 
 		 457 aa  349  5e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.94 
 
 		 455 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  50.94 
 
 		 455 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.94 
 
 		 455 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  50.61 
 
 		 494 aa  324  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  47.89 
 
 		 505 aa  322  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.46 
 
 		 508 aa  319  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.52 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  50.4 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  47.96 
 
 		 493 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  48.28 
 
 		 527 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000139928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.59 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  46.37 
 
 		 551 aa  301  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.75 
 
 		 539 aa  300  6e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  45 
 
 		 517 aa  298  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  48.62 
 
 		 509 aa  293  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  46.12 
 
 		 502 aa  293  6e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  48.87 
 
 		 480 aa  286  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  47.37 
 
 		 517 aa  282  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  46.71 
 
 		 486 aa  274  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  46.62 
 
 		 543 aa  263  4.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  33.26 
 
 		 452 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  33.88 
 
 		 453 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  29.74 
 
 		 455 aa  216  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  34.5 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  34.02 
 
 		 452 aa  206  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  34.09 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  34.16 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  28.39 
 
 		 444 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  33.54 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.89 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  33.87 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  33.54 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  32.99 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  39.54 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  29.25 
 
 		 449 aa  193  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  34.52 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  28.25 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  29.07 
 
 		 446 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  33.05 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  41.2 
 
 		 455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  28.97 
 
 		 456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  33.8 
 
 		 432 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  31.61 
 
 		 453 aa  181  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  31.46 
 
 		 448 aa  181  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  30.06 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  26.03 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  31.85 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  30.8 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  39.92 
 
 		 455 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  39.92 
 
 		 455 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  27.8 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  31 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  35.98 
 
 		 451 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  28.99 
 
 		 447 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  25.15 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  29.01 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  30.63 
 
 		 432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  29.18 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  36 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  29.07 
 
 		 444 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  35.41 
 
 		 501 aa  163  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  28.87 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  28.48 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  28.87 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  28.87 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  28.87 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  30.58 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  24.95 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  28.87 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  28.72 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  28.11 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  28.45 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  28.87 
 
 		 451 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  33.27 
 
 		 464 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.67 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.34 
 
 		 438 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  32.32 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.26 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  33.78 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  29.14 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  25.66 
 
 		 437 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  22.9 
 
 		 435 aa  150  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  22.9 
 
 		 435 aa  150  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  29.26 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  28.05 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>