More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1718 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  100 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  61.54 
 
 		 181 aa  227  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  62.09 
 
 		 180 aa  221  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  61.54 
 
 		 182 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  60.66 
 
 		 188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  60.96 
 
 		 186 aa  218  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  60.43 
 
 		 186 aa  217  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  58.33 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  61.93 
 
 		 183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  60.99 
 
 		 181 aa  214  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  59.34 
 
 		 182 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  61.2 
 
 		 181 aa  207  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  53.99 
 
 		 204 aa  181  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  55.83 
 
 		 197 aa  174  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  61.8 
 
 		 177 aa  171  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  51.53 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  52.1 
 
 		 180 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  46.82 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  51.88 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  46.49 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  50.93 
 
 		 162 aa  161  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  51.52 
 
 		 168 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  50.3 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  50.31 
 
 		 162 aa  157  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  48.77 
 
 		 162 aa  156  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  47.5 
 
 		 164 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  48.08 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  50.31 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  47.53 
 
 		 162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  46.91 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  44.38 
 
 		 213 aa  141  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  52.41 
 
 		 178 aa  141  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  43.83 
 
 		 163 aa  141  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  46.51 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  49.66 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  54.61 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  48.08 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  43.4 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  43.39 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  45.78 
 
 		 182 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  44.77 
 
 		 183 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  43.5 
 
 		 192 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  38.41 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  40.95 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  40.96 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  43.89 
 
 		 197 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  43.9 
 
 		 225 aa  127  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  43.92 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  42.38 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  44.05 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  44.08 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  44.69 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  41.9 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  43.02 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  45.39 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  44.69 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  44.69 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  42.28 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  44.94 
 
 		 200 aa  124  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  40.24 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  47.26 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  40.7 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  40.7 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  47.24 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  44.08 
 
 		 150 aa  124  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  45.33 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  42.13 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  41.62 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  39.73 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  39.39 
 
 		 187 aa  121  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  39.39 
 
 		 187 aa  121  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  41.67 
 
 		 197 aa  121  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  41.82 
 
 		 171 aa  121  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  46.71 
 
 		 154 aa  121  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  37.14 
 
 		 182 aa  121  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  42.42 
 
 		 171 aa  121  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  40.96 
 
 		 174 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  42.42 
 
 		 171 aa  121  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  40.82 
 
 		 188 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  38.92 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  41.08 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  42.77 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  44.3 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  41.45 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  37.43 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  47.26 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  38.71 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  37.65 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  41.89 
 
 		 168 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  41.28 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  43.24 
 
 		 159 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  39.29 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  39.29 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  42.35 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  40.33 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  41.89 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  43.04 
 
 		 173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  41.67 
 
 		 177 aa  118  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>