More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1706 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
309 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  92.69 
 
 
318 aa  560  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  81.67 
 
 
313 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  82.53 
 
 
310 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  80.07 
 
 
323 aa  487  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  78.15 
 
 
302 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  78.15 
 
 
328 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  76 
 
 
311 aa  472  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  76.16 
 
 
313 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  76.74 
 
 
306 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  74.83 
 
 
309 aa  458  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.9 
 
 
324 aa  457  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  74.43 
 
 
308 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  74.43 
 
 
308 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  74.67 
 
 
312 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.47 
 
 
323 aa  424  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  71.47 
 
 
332 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.32 
 
 
337 aa  425  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  69.66 
 
 
351 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.39 
 
 
342 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  65.96 
 
 
349 aa  418  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  67.79 
 
 
335 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  66.77 
 
 
327 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  66.78 
 
 
310 aa  401  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  65.74 
 
 
333 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.63 
 
 
315 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  68.28 
 
 
320 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.01 
 
 
319 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  63.38 
 
 
318 aa  391  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.67 
 
 
315 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2404  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.74 
 
 
316 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2363  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.74 
 
 
316 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0607904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2410  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.74 
 
 
316 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  62.78 
 
 
316 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5245  aspartate carbamoyltransferase  65.46 
 
 
311 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  60.71 
 
 
319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.23 
 
 
313 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  53.95 
 
 
313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
312 aa  334  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.64 
 
 
318 aa  333  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  56.86 
 
 
306 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  56.9 
 
 
309 aa  330  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.81 
 
 
310 aa  330  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.81 
 
 
310 aa  329  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.78 
 
 
317 aa  329  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.52 
 
 
307 aa  329  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  56.04 
 
 
320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  55.7 
 
 
312 aa  326  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  51.32 
 
 
311 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.9 
 
 
313 aa  325  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.64 
 
 
308 aa  323  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.75 
 
 
318 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  55.22 
 
 
313 aa  322  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.85 
 
 
311 aa  322  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.11 
 
 
315 aa  322  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.11 
 
 
315 aa  322  7e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.11 
 
 
315 aa  322  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
307 aa  321  8e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.11 
 
 
316 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.17 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
313 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.11 
 
 
316 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.36 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.59 
 
 
318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.59 
 
 
318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.54 
 
 
321 aa  320  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.92 
 
 
322 aa  319  5e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.76 
 
 
334 aa  318  6e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.08 
 
 
336 aa  318  6e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.01 
 
 
307 aa  318  7e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57 
 
 
316 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.59 
 
 
322 aa  318  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.59 
 
 
322 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.29 
 
 
316 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.88 
 
 
312 aa  317  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  51.01 
 
 
309 aa  317  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1359  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.26 
 
 
319 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.9 
 
 
318 aa  316  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.77 
 
 
317 aa  316  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.3 
 
 
318 aa  316  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  54.58 
 
 
314 aa  316  4e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  53.72 
 
 
326 aa  315  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.01 
 
 
306 aa  315  8e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.84 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.24 
 
 
311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.77 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2007  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.11 
 
 
362 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  51.69 
 
 
307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.63 
 
 
313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.63 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.63 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.46 
 
 
335 aa  312  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.01 
 
 
308 aa  312  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  50.66 
 
 
313 aa  311  7.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
311 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  56.86 
 
 
319 aa  309  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  51.25 
 
 
312 aa  308  5e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0223  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.77 
 
 
320 aa  308  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40055  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.35 
 
 
315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.75 
 
 
323 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>