More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1700 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1700  shikimate kinase  100 
 
 		 187 aa  352  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3208  shikimate kinase  70 
 
 		 225 aa  190  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  59.04 
 
 		 171 aa  177  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  56.36 
 
 		 172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2020  shikimate kinase  60 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2389  Shikimate kinase  60.54 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  55.35 
 
 		 172 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  58.13 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  55.62 
 
 		 165 aa  158  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1834  Shikimate kinase  56.97 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.252132  normal  0.208051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0877  Shikimate kinase  51.52 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.317471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  56.77 
 
 		 519 aa  153  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  54.84 
 
 		 577 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3152  Shikimate kinase  55.35 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5254  Shikimate kinase  50.93 
 
 		 171 aa  144  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2413  shikimate kinase  53.89 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1839  shikimate kinase  57.66 
 
 		 167 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  47.31 
 
 		 180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17860  shikimate kinase  49.14 
 
 		 188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.114511  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4297  Shikimate kinase  50 
 
 		 179 aa  138  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.911234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1846  shikimate kinase  57.66 
 
 		 167 aa  134  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1335  shikimate kinase  47.68 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.89172  normal  0.76234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  48.17 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2394  shikimate kinase  44.85 
 
 		 235 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0537211  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2353  shikimate kinase  44.85 
 
 		 235 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2400  shikimate kinase  44.85 
 
 		 235 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  44.24 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  42.42 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2617  Shikimate kinase  42.2 
 
 		 206 aa  117  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  43.4 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  42.61 
 
 		 591 aa  111  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0168  shikimate kinase  43.37 
 
 		 178 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00656319  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0150  shikimate kinase  43.37 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  41.36 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  44.72 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  38.99 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  42.11 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2326  Shikimate kinase  45.4 
 
 		 185 aa  104  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0927033  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15020  shikimate kinase  40.85 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0201152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  39.75 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  43.84 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  44.05 
 
 		 171 aa  101  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  45.58 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  45.58 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  45.58 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  40.99 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  43.45 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  41.61 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  46.26 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  35.98 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  40.31 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  40.12 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  41.57 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0238  shikimate kinase I  42.68 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000334252  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1113  shikimate kinase  44.37 
 
 		 163 aa  99.4  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0015491  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  43.45 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  43.45 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  42.86 
 
 		 171 aa  99.4  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  43.45 
 
 		 171 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  42.86 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0340  shikimate kinase I  43.29 
 
 		 171 aa  99  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  42.86 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  42.86 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  42.86 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  46.26 
 
 		 173 aa  99  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  36.65 
 
 		 495 aa  98.6  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  42.68 
 
 		 171 aa  98.2  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  44.9 
 
 		 173 aa  98.2  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  45.21 
 
 		 174 aa  98.2  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0213  shikimate kinase I  43.84 
 
 		 171 aa  97.8  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000106831  hitchhiker  0.00783685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  43.79 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  38.24 
 
 		 179 aa  97.4  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  38.24 
 
 		 179 aa  97.4  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  45.58 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  45.58 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4265  shikimate kinase I  42.68 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  45.58 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  38.75 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  45.58 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  45.58 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0375  shikimate kinase I  42.68 
 
 		 171 aa  97.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00773873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  38.89 
 
 		 593 aa  97.1  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  45.58 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  45.58 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  41.1 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  44.9 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  35.12 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  45.58 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  45.58 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  44.9 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  44.9 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  44.9 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  44.9 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  39.16 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  40.12 
 
 		 169 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  39.57 
 
 		 229 aa  95.9  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  42.33 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  36.02 
 
 		 172 aa  95.9  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  45.58 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  31.93 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>