More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1681 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  428  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  44.81 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 189 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  45.95 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 191 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 310 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 183 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1170  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  31.93 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2680  transcriptional regulator  24.51 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  55.32 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2718  transcriptional regulator, TetR family domain protein  24.51 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.087281  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  55.32 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>