More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1639 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  540  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  54.8 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 290 aa  265  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4276  AraC family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2370  AraC family transcriptional regulator  50.58 
 
 		 284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2730  AraC family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2744  AraC family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2700  AraC family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5383  AraC family transcriptional regulator  48.93 
 
 		 237 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3314  AraC family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 236 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4557  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.194506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3835  transcriptional regulator, AraC family  37.4 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1294  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 252 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0435473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1352  helix-turn-helix domain-containing protein  31.14 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.436375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6124  transcriptional regulator, AraC family  25.54 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1772  transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  26.97 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  27.51 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  28.27 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  32.75 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  27.35 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  25.99 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  29.44 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2080  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  26.32 
 
 		 268 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13867  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  31 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2443  helix-turn-helix domain-containing protein  26.89 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  32.03 
 
 		 305 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0964  AraC/XylS family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.541857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04860  hypothetical protein  25.71 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  28 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  27.73 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3559  transcriptional regulator, AraC family  28.14 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001035  transcriptional regulator AraC/XylS family  25.75 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  31 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1081  AraC family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  27.51 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  31.09 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5572  transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  33.19 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7867  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.7 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4654  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  25.33 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>