More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1556 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  100 
 
 
349 aa  716    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  71.47 
 
 
348 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  68.6 
 
 
344 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  68.12 
 
 
344 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  56.98 
 
 
343 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  59.44 
 
 
345 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  57.02 
 
 
342 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  59.88 
 
 
368 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  56.48 
 
 
344 aa  364  1e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  55.52 
 
 
340 aa  363  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  55.94 
 
 
349 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  53.87 
 
 
344 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  55.72 
 
 
343 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  56.92 
 
 
341 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  52.91 
 
 
339 aa  349  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  56.07 
 
 
341 aa  345  8e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  56 
 
 
341 aa  343  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  53.45 
 
 
345 aa  335  5e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  53.42 
 
 
343 aa  325  9e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  53.4 
 
 
339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  53.4 
 
 
339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  53.09 
 
 
339 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
339 aa  305  9.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  45.75 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3948  aldo/keto reductase  44.13 
 
 
357 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0477  aldo/keto reductase  46.65 
 
 
348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  45.16 
 
 
333 aa  265  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  43.48 
 
 
315 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  43.9 
 
 
341 aa  249  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  41.69 
 
 
349 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  43.34 
 
 
331 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  45.48 
 
 
317 aa  242  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  41.8 
 
 
331 aa  242  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.37 
 
 
332 aa  242  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  45.18 
 
 
319 aa  241  9e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  44.92 
 
 
338 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  43.47 
 
 
325 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  42.95 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  42.15 
 
 
352 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  41.1 
 
 
313 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  41.9 
 
 
325 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  38.46 
 
 
338 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
353 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  41.18 
 
 
331 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  40.94 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  42.33 
 
 
309 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4073  aldo/keto reductase  44.48 
 
 
311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  42.06 
 
 
334 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  40.91 
 
 
326 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  42.06 
 
 
336 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
315 aa  229  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  40.99 
 
 
349 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  40.49 
 
 
335 aa  228  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  42.23 
 
 
313 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  40.81 
 
 
334 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  42.68 
 
 
354 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
350 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
325 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  42.25 
 
 
328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  41.05 
 
 
341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
323 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  37.27 
 
 
316 aa  225  8e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  38.58 
 
 
349 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  38.24 
 
 
349 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  38.94 
 
 
317 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  40.4 
 
 
323 aa  225  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
329 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  43.34 
 
 
323 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  41.23 
 
 
332 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1876  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
317 aa  223  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0609138 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  38.24 
 
 
349 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
326 aa  223  4e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  39.05 
 
 
350 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  44.71 
 
 
317 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  39.17 
 
 
349 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  39.17 
 
 
349 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  39.33 
 
 
349 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.94 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  40 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
327 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  37.58 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  41.27 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  41.27 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  41.1 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  39.3 
 
 
339 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  37.87 
 
 
348 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  40.94 
 
 
322 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
357 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1755  aldo/keto reductase  40.84 
 
 
323 aa  219  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000557671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  40.99 
 
 
339 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  40.81 
 
 
353 aa  219  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  38.02 
 
 
344 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.63 
 
 
324 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  39.25 
 
 
354 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.12 
 
 
324 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>