More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1554 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  97.35 
 
 
377 aa  733    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  86.47 
 
 
377 aa  661    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
377 aa  775    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  84.84 
 
 
375 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  77.95 
 
 
326 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  82.41 
 
 
299 aa  501  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  64.72 
 
 
410 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  64.56 
 
 
368 aa  490  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  63.66 
 
 
405 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  63.13 
 
 
410 aa  478  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  65.52 
 
 
405 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  62.9 
 
 
376 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  62.53 
 
 
381 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  65.25 
 
 
410 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  63.61 
 
 
381 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  62.53 
 
 
381 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  53.44 
 
 
391 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  53.46 
 
 
395 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  53.46 
 
 
403 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  52.91 
 
 
391 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  54.03 
 
 
381 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  53.72 
 
 
390 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  53.21 
 
 
391 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  53.49 
 
 
381 aa  388  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  51.61 
 
 
408 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  50.67 
 
 
416 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  52.94 
 
 
373 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  47.71 
 
 
377 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  48.51 
 
 
367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  48.51 
 
 
367 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  45.09 
 
 
424 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  46.39 
 
 
406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  42.89 
 
 
393 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  43.05 
 
 
393 aa  289  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  42.59 
 
 
362 aa  287  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  41.03 
 
 
403 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  41.03 
 
 
403 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  41.03 
 
 
403 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  41.03 
 
 
403 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  40.57 
 
 
440 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  40.49 
 
 
403 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  40 
 
 
384 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  40.88 
 
 
427 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  40.88 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  41.16 
 
 
392 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  41.99 
 
 
450 aa  270  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  41.99 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  41.89 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  41.06 
 
 
417 aa  269  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  41.42 
 
 
435 aa  269  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  39.34 
 
 
370 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  40.1 
 
 
405 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  38.75 
 
 
370 aa  265  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  39.5 
 
 
383 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  39.5 
 
 
383 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  39.5 
 
 
383 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  39.44 
 
 
383 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  41.35 
 
 
370 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  39.78 
 
 
383 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  39.78 
 
 
383 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  41.16 
 
 
392 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  38.48 
 
 
370 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  38.78 
 
 
373 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  39.07 
 
 
393 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  38.06 
 
 
370 aa  262  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  38.75 
 
 
370 aa  262  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  39.23 
 
 
383 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.7 
 
 
372 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  38.52 
 
 
393 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  38.08 
 
 
384 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  38.08 
 
 
384 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  36.86 
 
 
370 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  37.26 
 
 
370 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  41.86 
 
 
384 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  37.82 
 
 
384 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  38.4 
 
 
373 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  37.98 
 
 
370 aa  260  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  38.4 
 
 
373 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  38.4 
 
 
373 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  37.82 
 
 
384 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  36.89 
 
 
370 aa  259  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  37.82 
 
 
384 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  39.06 
 
 
373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  38.52 
 
 
394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  40.16 
 
 
399 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  37.56 
 
 
384 aa  258  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  38.16 
 
 
383 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  38.16 
 
 
383 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  37.82 
 
 
384 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  37.82 
 
 
384 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  38.5 
 
 
372 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  37.37 
 
 
383 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  39.14 
 
 
394 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  39.14 
 
 
394 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  37.56 
 
 
384 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  37.56 
 
 
384 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  37.56 
 
 
384 aa  256  7e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  38.5 
 
 
372 aa  255  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  39.84 
 
 
396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  37.31 
 
 
384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>