150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1552 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  100 
 
 		 395 aa  776    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  75.85 
 
 		 364 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  75.99 
 
 		 363 aa  538  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  71.23 
 
 		 359 aa  531  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.76 
 
 		 378 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.17 
 
 		 379 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  74.37 
 
 		 361 aa  522  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  73.45 
 
 		 355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  69.21 
 
 		 360 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.47 
 
 		 366 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  67.32 
 
 		 364 aa  508  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.47 
 
 		 364 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.65 
 
 		 371 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  74.72 
 
 		 362 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  74.86 
 
 		 380 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  69.8 
 
 		 366 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.09 
 
 		 366 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.8 
 
 		 366 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  67.61 
 
 		 365 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  64.89 
 
 		 358 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.06 
 
 		 361 aa  408  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  46.13 
 
 		 370 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.13 
 
 		 373 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  45.92 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  46.11 
 
 		 370 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.37 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  48.6 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.53 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  44.17 
 
 		 372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.98 
 
 		 385 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.33 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  46.6 
 
 		 391 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  45.78 
 
 		 378 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.18 
 
 		 363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  48.32 
 
 		 369 aa  252  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  41.92 
 
 		 362 aa  239  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  41.92 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  41.92 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  41.92 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  41.92 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  41.92 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  41.64 
 
 		 362 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.64 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  43.09 
 
 		 376 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  41.22 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.7 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.48 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.93 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  32.52 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  28.42 
 
 		 743 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  28 
 
 		 318 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  27.59 
 
 		 288 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.78 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.54 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  28.12 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.92 
 
 		 743 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  28.12 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.68 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  26.78 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  28.67 
 
 		 263 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  28.67 
 
 		 263 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.27 
 
 		 294 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  30.19 
 
 		 4979 aa  50.1  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.38 
 
 		 302 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30 
 
 		 302 aa  50.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  23.83 
 
 		 315 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  28.63 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  26.21 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  26.69 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  26.5 
 
 		 291 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.36 
 
 		 304 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  26.04 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  24.83 
 
 		 284 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  24.07 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  29.05 
 
 		 810 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  23.53 
 
 		 311 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  27.4 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.09 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.23 
 
 		 306 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.33 
 
 		 290 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.34 
 
 		 295 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.23 
 
 		 306 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  30 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.96 
 
 		 298 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  26.47 
 
 		 297 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.96 
 
 		 298 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  22.62 
 
 		 315 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  25.44 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  25.44 
 
 		 297 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  25.44 
 
 		 297 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  25.44 
 
 		 297 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  25.44 
 
 		 297 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  25.44 
 
 		 297 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0108  ATPase  29.67 
 
 		 292 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0213616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  25.44 
 
 		 297 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  30.56 
 
 		 655 aa  47  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  25.44 
 
 		 297 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  24.22 
 
 		 303 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.69 
 
 		 295 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  26.19 
 
 		 301 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>