More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1345 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 130 aa  258  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  62.31 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  58.91 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  63.08 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  57.6 
 
 		 129 aa  140  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  57.89 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  54.4 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  52.46 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  51.22 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  38.52 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  46.05 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  33.67 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  30 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 547 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0365  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  35.8 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  40 
 
 		 482 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  29.37 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  37.7 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  37.18 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4641  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  37.8 
 
 		 321 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1621  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  30.17 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  39.02 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  38.96 
 
 		 554 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 473 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.85 
 
 		 468 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 476 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  33.64 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  44.74 
 
 		 470 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>