191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1281 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  100 
 
 
364 aa  704    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  78.79 
 
 
365 aa  508  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  59.05 
 
 
366 aa  422  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  61.05 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  59.89 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  56.91 
 
 
378 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  57.62 
 
 
356 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  55.15 
 
 
360 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  56.42 
 
 
360 aa  363  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  53.99 
 
 
361 aa  359  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  57.53 
 
 
368 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  54.49 
 
 
360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  57.26 
 
 
368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  57.26 
 
 
368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  56.79 
 
 
362 aa  352  4e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  56.2 
 
 
362 aa  340  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  53.78 
 
 
362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  54.29 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  54.12 
 
 
361 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  53.19 
 
 
388 aa  330  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  54.37 
 
 
359 aa  322  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  52.97 
 
 
354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  52.39 
 
 
359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  48.24 
 
 
358 aa  296  5e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  50.42 
 
 
367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  52.35 
 
 
359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  49.13 
 
 
357 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  46.74 
 
 
358 aa  277  3e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  26.58 
 
 
390 aa  95.9  9e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.2 
 
 
438 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  27.4 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  31.37 
 
 
440 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  28.46 
 
 
433 aa  90.5  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  25.49 
 
 
426 aa  89.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  28.61 
 
 
421 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  27.9 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  29.77 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  33.16 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  28.45 
 
 
428 aa  84  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  26.42 
 
 
445 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  26.81 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  29.14 
 
 
408 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  29.14 
 
 
408 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  29.14 
 
 
408 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  27.72 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  29.7 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  30.46 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  28.57 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  29.29 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  31.84 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  31.84 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  31.84 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  26.58 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  22.62 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.94 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  27.73 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  31.94 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.64 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  25.12 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  32.66 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  31.31 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  30.48 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  25.31 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30.85 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  28.25 
 
 
426 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  30.11 
 
 
426 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.08 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  27.23 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  29.95 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  27.18 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25.94 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  27.41 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  35.75 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  29.77 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  27.67 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  28.5 
 
 
430 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  32.54 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  30.08 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  30.08 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  32.06 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  25.38 
 
 
440 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  28.78 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  23.5 
 
 
413 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  29.55 
 
 
478 aa  67  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  31.22 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  32.17 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.77 
 
 
433 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  27.91 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  30.73 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  28.17 
 
 
450 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  29 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  24.61 
 
 
441 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  27.79 
 
 
422 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  31.15 
 
 
428 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  25.2 
 
 
426 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  24.72 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  29.7 
 
 
405 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  24.14 
 
 
432 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  23.17 
 
 
401 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  28.7 
 
 
443 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>