More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1231 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  100 
 
 		 503 aa  988    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  82.94 
 
 		 486 aa  719    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  71.81 
 
 		 512 aa  620  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  68.67 
 
 		 502 aa  608  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  68.64 
 
 		 485 aa  597  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  68.83 
 
 		 493 aa  594  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  68.27 
 
 		 501 aa  586  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  66.24 
 
 		 509 aa  586  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  64.98 
 
 		 522 aa  586  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  68.5 
 
 		 521 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  63.98 
 
 		 512 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  68.2 
 
 		 494 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  68.43 
 
 		 479 aa  577  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  63.31 
 
 		 553 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  64.45 
 
 		 482 aa  569  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  65.55 
 
 		 493 aa  568  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  66.37 
 
 		 484 aa  566  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  65.08 
 
 		 515 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  67.3 
 
 		 505 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  66.81 
 
 		 515 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  66.3 
 
 		 493 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  66.81 
 
 		 487 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  65.6 
 
 		 494 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  67.7 
 
 		 483 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  67.92 
 
 		 483 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  65.25 
 
 		 524 aa  550  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  67.7 
 
 		 483 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  63.92 
 
 		 515 aa  545  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  63.07 
 
 		 530 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  62.4 
 
 		 517 aa  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  63.8 
 
 		 546 aa  540  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  67.92 
 
 		 480 aa  539  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  66.59 
 
 		 482 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  67.04 
 
 		 482 aa  531  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  66.52 
 
 		 466 aa  525  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  63.28 
 
 		 495 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  58.65 
 
 		 501 aa  489  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  53.62 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  47.85 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  47.85 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  47.16 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  60.72 
 
 		 384 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  46.75 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  50.98 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  45.75 
 
 		 582 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  45.71 
 
 		 395 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  51.66 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.84 
 
 		 441 aa  323  6e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  42.24 
 
 		 437 aa  323  7e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  44.13 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  43.65 
 
 		 413 aa  320  5e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  45.69 
 
 		 596 aa  319  6e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  47.45 
 
 		 442 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  49.6 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  44.67 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  47.37 
 
 		 429 aa  310  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  43.4 
 
 		 454 aa  310  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  44.67 
 
 		 489 aa  309  6.999999999999999e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  44.33 
 
 		 461 aa  309  6.999999999999999e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  41.08 
 
 		 419 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  43.4 
 
 		 454 aa  307  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  46.84 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  44.76 
 
 		 430 aa  306  6e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  45.5 
 
 		 429 aa  306  7e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  38.68 
 
 		 419 aa  306  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  40.85 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.69 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  48.25 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  44.67 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.69 
 
 		 419 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.2 
 
 		 419 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  46.49 
 
 		 432 aa  302  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  45.22 
 
 		 435 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  40.44 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  40.2 
 
 		 419 aa  301  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  42.48 
 
 		 415 aa  300  3e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  45.24 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.2 
 
 		 419 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  49.08 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  45.34 
 
 		 426 aa  300  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  45.85 
 
 		 426 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  44.04 
 
 		 435 aa  299  9e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  44.39 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  46.28 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  44.39 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  37.86 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  44.39 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  45.34 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  45.34 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  45.34 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  40.2 
 
 		 419 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  47.76 
 
 		 450 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  43.89 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  45.34 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  40.2 
 
 		 419 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  47.75 
 
 		 553 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  45.34 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  45.34 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  45.34 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  45.6 
 
 		 426 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>