162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1204 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  59.41 
 
 		 289 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  39.68 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  36.61 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  36.78 
 
 		 243 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  33.06 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  27.31 
 
 		 251 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  31.76 
 
 		 565 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  28.78 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  28.27 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 249 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  26.97 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  26.97 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  28.21 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  22.43 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  24 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  23.49 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  23.7 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  24.06 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  29.73 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  26.41 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0794  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.51 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  27.47 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  23.77 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  25.87 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  36 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  26.67 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  27.74 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  35.8 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  25.45 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  20.24 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  36.11 
 
 		 189 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  36.11 
 
 		 189 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  22.76 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  36.11 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  37.1 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  24.54 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  24.54 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  37.1 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  23.94 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  37.1 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  36.62 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  34.55 
 
 		 448 aa  55.8  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  29.59 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  37.1 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  20.45 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  25.66 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  35.21 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  28.42 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  22.46 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  22.74 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  24.73 
 
 		 278 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  34.72 
 
 		 266 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  35.79 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  33.33 
 
 		 263 aa  53.1  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  27.39 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  23.99 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  22.41 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  25.97 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  26.43 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  36.07 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  22.86 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  24.57 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  30.88 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10680  hypothetical protein  35.53 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0331666  unclonable  0.0000000019821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  24.03 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  34.29 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  34.29 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  34.29 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  34.29 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 130 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  24.35 
 
 		 266 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  34.51 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7851  putative dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component  37.18 
 
 		 138 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187793  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  35.59 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  25.8 
 
 		 374 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  22.3 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  20.65 
 
 		 245 aa  49.7  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 325 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  36.11 
 
 		 360 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  28.81 
 
 		 368 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  36.11 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  19 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  36.11 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  36.11 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  36.11 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  28.81 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0955  hypothetical protein  32.39 
 
 		 191 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000127894  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  36.11 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  27.75 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  36.36 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  36.36 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>